Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chsy1Q6ZQ11 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chsy1Q6ZQ11 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chsy1Q6ZQ11 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chsy1Q6ZQ11 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chsy1Q6ZQ11 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chsy1Q6ZQ11 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chsy1Q6ZQ11 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chsy1Q6ZQ11 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chsy1Q6ZQ11 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chsy1Q6ZQ11 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chsy1Q6ZQ11 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chsy1Q6ZQ11 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chsy1Q6ZQ11 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chsy1Q6ZQ11 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chsy1Q6ZQ11 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chsy1Q6ZQ11 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chsy1Q6ZQ11 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Chsy1Q6ZQ11 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chsy1Q6ZQ11 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chsy1Q6ZQ11 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chsy1Q6ZQ11 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chsy1Q6ZQ11 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chsy1Q6ZQ11 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Chsy1Q6ZQ11 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chsy1Q6ZQ11 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chsy1Q6ZQ11 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chsy1Q6ZQ11 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Chsy1Q6ZQ11 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chsy1Q6ZQ11 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chsy1Q6ZQ11 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chsy1Q6ZQ11 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chsy1Q6ZQ11 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chsy1Q6ZQ11 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chsy1Q6ZQ11 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chsy1Q6ZQ11 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chsy1Q6ZQ11 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chsy1Q6ZQ11 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chsy1Q6ZQ11 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chsy1Q6ZQ11 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chsy1Q6ZQ11 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chsy1Q6ZQ11 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chsy1Q6ZQ11 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chsy1Q6ZQ11 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chsy1Q6ZQ11 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chsy1Q6ZQ11 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Chsy1Q6ZQ11 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chsy1Q6ZQ11 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chsy1Q6ZQ11 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chsy1Q6ZQ11 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Chsy1Q6ZQ11 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chsy1Q6ZQ11 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Chsy1Q6ZQ11 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chsy1Q6ZQ11 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chsy1Q6ZQ11 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chsy1Q6ZQ11 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chsy1Q6ZQ11 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chsy1Q6ZQ11 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chsy1Q6ZQ11 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chsy1Q6ZQ11 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chsy1Q6ZQ11 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chsy1Q6ZQ11 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chsy1Q6ZQ11 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chsy1Q6ZQ11 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chsy1Q6ZQ11 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Chsy1Q6ZQ11 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chsy1Q6ZQ11 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chsy1Q6ZQ11 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chsy1Q6ZQ11 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chsy1Q6ZQ11 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chsy1Q6ZQ11 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chsy1Q6ZQ11 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chsy1Q6ZQ11 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Chsy1Q6ZQ11 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chsy1Q6ZQ11 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chsy1Q6ZQ11 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chsy1Q6ZQ11 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chsy1Q6ZQ11 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chsy1Q6ZQ11 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chsy1Q6ZQ11 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chsy1Q6ZQ11 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chsy1Q6ZQ11 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chsy1Q6ZQ11 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chsy1Q6ZQ11 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chsy1Q6ZQ11 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chsy1Q6ZQ11 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chsy1Q6ZQ11 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chsy1Q6ZQ11 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chsy1Q6ZQ11 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chsy1Q6ZQ11 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chsy1Q6ZQ11 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chsy1Q6ZQ11 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chsy1Q6ZQ11 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chsy1Q6ZQ11 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Chsy1Q6ZQ11 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chsy1Q6ZQ11 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chsy1Q6ZQ11 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
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