Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R3

Crip3, Cysteine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip3Q6Q6R3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crip3Q6Q6R3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crip3Q6Q6R3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crip3Q6Q6R3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crip3Q6Q6R3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Crip3Q6Q6R3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Crip3Q6Q6R3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Crip3Q6Q6R3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Crip3Q6Q6R3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Crip3Q6Q6R3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Crip3Q6Q6R3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Crip3Q6Q6R3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Crip3Q6Q6R3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Crip3Q6Q6R3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Crip3Q6Q6R3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Crip3Q6Q6R3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Crip3Q6Q6R3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Crip3Q6Q6R3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Crip3Q6Q6R3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Crip3Q6Q6R3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Crip3Q6Q6R3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Crip3Q6Q6R3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Crip3Q6Q6R3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Crip3Q6Q6R3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Crip3Q6Q6R3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Crip3Q6Q6R3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Crip3Q6Q6R3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Crip3Q6Q6R3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Crip3Q6Q6R3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Crip3Q6Q6R3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Crip3Q6Q6R3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Crip3Q6Q6R3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Crip3Q6Q6R3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Crip3Q6Q6R3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Crip3Q6Q6R3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Crip3Q6Q6R3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Crip3Q6Q6R3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Crip3Q6Q6R3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Crip3Q6Q6R3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Crip3Q6Q6R3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Crip3Q6Q6R3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Crip3Q6Q6R3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Crip3Q6Q6R3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Crip3Q6Q6R3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Crip3Q6Q6R3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Crip3Q6Q6R3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Crip3Q6Q6R3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Crip3Q6Q6R3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Crip3Q6Q6R3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Crip3Q6Q6R3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Crip3Q6Q6R3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Crip3Q6Q6R3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Crip3Q6Q6R3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Crip3Q6Q6R3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Crip3Q6Q6R3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Crip3Q6Q6R3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Crip3Q6Q6R3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Crip3Q6Q6R3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Crip3Q6Q6R3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Crip3Q6Q6R3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Crip3Q6Q6R3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Crip3Q6Q6R3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Crip3Q6Q6R3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Crip3Q6Q6R3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Crip3Q6Q6R3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Crip3Q6Q6R3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Crip3Q6Q6R3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Crip3Q6Q6R3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Crip3Q6Q6R3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Crip3Q6Q6R3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Crip3Q6Q6R3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Crip3Q6Q6R3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Crip3Q6Q6R3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crip3Q6Q6R3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Crip3Q6Q6R3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Crip3Q6Q6R3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Crip3Q6Q6R3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Crip3Q6Q6R3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Crip3Q6Q6R3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Crip3Q6Q6R3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Crip3Q6Q6R3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Crip3Q6Q6R3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Crip3Q6Q6R3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Crip3Q6Q6R3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Crip3Q6Q6R3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Crip3Q6Q6R3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Crip3Q6Q6R3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Crip3Q6Q6R3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Crip3Q6Q6R3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Crip3Q6Q6R3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Crip3Q6Q6R3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crip3Q6Q6R3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crip3Q6Q6R3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crip3Q6Q6R3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crip3Q6Q6R3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crip3Q6Q6R3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crip3Q6Q6R3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crip3Q6Q6R3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crip3Q6Q6R3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Crip3Q6Q6R3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms