Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GmipQ6PGG2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GmipQ6PGG2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GmipQ6PGG2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GmipQ6PGG2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GmipQ6PGG2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GmipQ6PGG2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GmipQ6PGG2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GmipQ6PGG2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GmipQ6PGG2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GmipQ6PGG2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GmipQ6PGG2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GmipQ6PGG2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GmipQ6PGG2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GmipQ6PGG2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GmipQ6PGG2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GmipQ6PGG2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GmipQ6PGG2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GmipQ6PGG2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GmipQ6PGG2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GmipQ6PGG2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GmipQ6PGG2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GmipQ6PGG2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GmipQ6PGG2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GmipQ6PGG2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GmipQ6PGG2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GmipQ6PGG2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GmipQ6PGG2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GmipQ6PGG2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GmipQ6PGG2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GmipQ6PGG2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GmipQ6PGG2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GmipQ6PGG2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GmipQ6PGG2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GmipQ6PGG2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GmipQ6PGG2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GmipQ6PGG2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GmipQ6PGG2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GmipQ6PGG2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GmipQ6PGG2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GmipQ6PGG2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GmipQ6PGG2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GmipQ6PGG2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GmipQ6PGG2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GmipQ6PGG2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GmipQ6PGG2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GmipQ6PGG2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GmipQ6PGG2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GmipQ6PGG2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GmipQ6PGG2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GmipQ6PGG2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GmipQ6PGG2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GmipQ6PGG2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GmipQ6PGG2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GmipQ6PGG2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GmipQ6PGG2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GmipQ6PGG2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GmipQ6PGG2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GmipQ6PGG2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GmipQ6PGG2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GmipQ6PGG2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GmipQ6PGG2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GmipQ6PGG2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GmipQ6PGG2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GmipQ6PGG2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GmipQ6PGG2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GmipQ6PGG2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GmipQ6PGG2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GmipQ6PGG2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GmipQ6PGG2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GmipQ6PGG2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GmipQ6PGG2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GmipQ6PGG2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GmipQ6PGG2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GmipQ6PGG2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GmipQ6PGG2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GmipQ6PGG2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GmipQ6PGG2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GmipQ6PGG2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GmipQ6PGG2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GmipQ6PGG2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GmipQ6PGG2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GmipQ6PGG2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GmipQ6PGG2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GmipQ6PGG2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GmipQ6PGG2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GmipQ6PGG2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GmipQ6PGG2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GmipQ6PGG2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GmipQ6PGG2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GmipQ6PGG2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GmipQ6PGG2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GmipQ6PGG2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GmipQ6PGG2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GmipQ6PGG2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GmipQ6PGG2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GmipQ6PGG2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GmipQ6PGG2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GmipQ6PGG2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GmipQ6PGG2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms