Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmeff1Q6PFE7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmeff1Q6PFE7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmeff1Q6PFE7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmeff1Q6PFE7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmeff1Q6PFE7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmeff1Q6PFE7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmeff1Q6PFE7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmeff1Q6PFE7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmeff1Q6PFE7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmeff1Q6PFE7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmeff1Q6PFE7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmeff1Q6PFE7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmeff1Q6PFE7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmeff1Q6PFE7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmeff1Q6PFE7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmeff1Q6PFE7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmeff1Q6PFE7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmeff1Q6PFE7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmeff1Q6PFE7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmeff1Q6PFE7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmeff1Q6PFE7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmeff1Q6PFE7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmeff1Q6PFE7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmeff1Q6PFE7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmeff1Q6PFE7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmeff1Q6PFE7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmeff1Q6PFE7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmeff1Q6PFE7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmeff1Q6PFE7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmeff1Q6PFE7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tmeff1Q6PFE7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmeff1Q6PFE7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmeff1Q6PFE7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmeff1Q6PFE7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmeff1Q6PFE7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmeff1Q6PFE7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmeff1Q6PFE7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmeff1Q6PFE7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmeff1Q6PFE7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmeff1Q6PFE7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmeff1Q6PFE7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmeff1Q6PFE7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmeff1Q6PFE7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmeff1Q6PFE7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmeff1Q6PFE7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmeff1Q6PFE7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmeff1Q6PFE7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmeff1Q6PFE7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmeff1Q6PFE7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmeff1Q6PFE7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmeff1Q6PFE7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmeff1Q6PFE7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmeff1Q6PFE7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmeff1Q6PFE7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmeff1Q6PFE7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmeff1Q6PFE7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmeff1Q6PFE7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmeff1Q6PFE7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tmeff1Q6PFE7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmeff1Q6PFE7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmeff1Q6PFE7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmeff1Q6PFE7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmeff1Q6PFE7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmeff1Q6PFE7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmeff1Q6PFE7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmeff1Q6PFE7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmeff1Q6PFE7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmeff1Q6PFE7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmeff1Q6PFE7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmeff1Q6PFE7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmeff1Q6PFE7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmeff1Q6PFE7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmeff1Q6PFE7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmeff1Q6PFE7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmeff1Q6PFE7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmeff1Q6PFE7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmeff1Q6PFE7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmeff1Q6PFE7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmeff1Q6PFE7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmeff1Q6PFE7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmeff1Q6PFE7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmeff1Q6PFE7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmeff1Q6PFE7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmeff1Q6PFE7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmeff1Q6PFE7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmeff1Q6PFE7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmeff1Q6PFE7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmeff1Q6PFE7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmeff1Q6PFE7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms