Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrm2bQ6PEE3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrm2bQ6PEE3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrm2bQ6PEE3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrm2bQ6PEE3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrm2bQ6PEE3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rrm2bQ6PEE3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrm2bQ6PEE3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrm2bQ6PEE3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrm2bQ6PEE3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrm2bQ6PEE3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrm2bQ6PEE3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrm2bQ6PEE3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrm2bQ6PEE3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrm2bQ6PEE3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrm2bQ6PEE3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrm2bQ6PEE3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrm2bQ6PEE3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrm2bQ6PEE3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrm2bQ6PEE3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrm2bQ6PEE3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrm2bQ6PEE3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrm2bQ6PEE3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrm2bQ6PEE3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrm2bQ6PEE3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrm2bQ6PEE3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrm2bQ6PEE3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrm2bQ6PEE3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrm2bQ6PEE3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrm2bQ6PEE3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrm2bQ6PEE3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrm2bQ6PEE3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrm2bQ6PEE3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrm2bQ6PEE3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrm2bQ6PEE3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrm2bQ6PEE3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrm2bQ6PEE3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrm2bQ6PEE3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrm2bQ6PEE3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrm2bQ6PEE3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrm2bQ6PEE3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrm2bQ6PEE3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrm2bQ6PEE3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrm2bQ6PEE3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrm2bQ6PEE3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrm2bQ6PEE3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrm2bQ6PEE3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrm2bQ6PEE3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrm2bQ6PEE3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrm2bQ6PEE3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrm2bQ6PEE3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrm2bQ6PEE3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrm2bQ6PEE3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrm2bQ6PEE3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrm2bQ6PEE3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrm2bQ6PEE3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrm2bQ6PEE3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrm2bQ6PEE3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrm2bQ6PEE3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrm2bQ6PEE3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrm2bQ6PEE3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrm2bQ6PEE3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrm2bQ6PEE3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrm2bQ6PEE3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrm2bQ6PEE3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrm2bQ6PEE3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrm2bQ6PEE3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrm2bQ6PEE3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrm2bQ6PEE3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrm2bQ6PEE3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrm2bQ6PEE3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrm2bQ6PEE3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrm2bQ6PEE3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrm2bQ6PEE3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrm2bQ6PEE3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrm2bQ6PEE3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrm2bQ6PEE3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrm2bQ6PEE3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrm2bQ6PEE3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrm2bQ6PEE3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrm2bQ6PEE3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrm2bQ6PEE3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrm2bQ6PEE3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rrm2bQ6PEE3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrm2bQ6PEE3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrm2bQ6PEE3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrm2bQ6PEE3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrm2bQ6PEE3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrm2bQ6PEE3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrm2bQ6PEE3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrm2bQ6PEE3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrm2bQ6PEE3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrm2bQ6PEE3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrm2bQ6PEE3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrm2bQ6PEE3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrm2bQ6PEE3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrm2bQ6PEE3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrm2bQ6PEE3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrm2bQ6PEE3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrm2bQ6PEE3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms