Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trak2Q6P9N8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trak2Q6P9N8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trak2Q6P9N8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trak2Q6P9N8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trak2Q6P9N8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trak2Q6P9N8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trak2Q6P9N8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trak2Q6P9N8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trak2Q6P9N8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trak2Q6P9N8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trak2Q6P9N8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trak2Q6P9N8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trak2Q6P9N8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trak2Q6P9N8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trak2Q6P9N8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trak2Q6P9N8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trak2Q6P9N8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trak2Q6P9N8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trak2Q6P9N8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trak2Q6P9N8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trak2Q6P9N8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trak2Q6P9N8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trak2Q6P9N8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trak2Q6P9N8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trak2Q6P9N8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trak2Q6P9N8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trak2Q6P9N8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trak2Q6P9N8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trak2Q6P9N8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trak2Q6P9N8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Trak2Q6P9N8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trak2Q6P9N8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trak2Q6P9N8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trak2Q6P9N8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trak2Q6P9N8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trak2Q6P9N8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trak2Q6P9N8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trak2Q6P9N8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trak2Q6P9N8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trak2Q6P9N8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trak2Q6P9N8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trak2Q6P9N8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trak2Q6P9N8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trak2Q6P9N8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Trak2Q6P9N8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trak2Q6P9N8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trak2Q6P9N8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trak2Q6P9N8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trak2Q6P9N8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trak2Q6P9N8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trak2Q6P9N8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trak2Q6P9N8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Trak2Q6P9N8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trak2Q6P9N8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trak2Q6P9N8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trak2Q6P9N8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trak2Q6P9N8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Trak2Q6P9N8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trak2Q6P9N8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trak2Q6P9N8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trak2Q6P9N8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trak2Q6P9N8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trak2Q6P9N8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trak2Q6P9N8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trak2Q6P9N8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trak2Q6P9N8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trak2Q6P9N8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trak2Q6P9N8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trak2Q6P9N8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trak2Q6P9N8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trak2Q6P9N8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Trak2Q6P9N8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trak2Q6P9N8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trak2Q6P9N8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trak2Q6P9N8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trak2Q6P9N8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Trak2Q6P9N8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trak2Q6P9N8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trak2Q6P9N8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trak2Q6P9N8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trak2Q6P9N8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Trak2Q6P9N8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trak2Q6P9N8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trak2Q6P9N8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trak2Q6P9N8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trak2Q6P9N8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trak2Q6P9N8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trak2Q6P9N8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trak2Q6P9N8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trak2Q6P9N8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trak2Q6P9N8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trak2Q6P9N8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trak2Q6P9N8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trak2Q6P9N8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trak2Q6P9N8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Trak2Q6P9N8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trak2Q6P9N8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trak2Q6P9N8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trak2Q6P9N8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms