Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam222bQ6P539 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam222bQ6P539 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam222bQ6P539 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam222bQ6P539 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam222bQ6P539 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam222bQ6P539 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam222bQ6P539 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam222bQ6P539 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam222bQ6P539 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam222bQ6P539 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam222bQ6P539 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam222bQ6P539 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam222bQ6P539 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam222bQ6P539 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam222bQ6P539 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam222bQ6P539 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam222bQ6P539 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam222bQ6P539 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam222bQ6P539 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam222bQ6P539 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam222bQ6P539 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam222bQ6P539 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam222bQ6P539 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam222bQ6P539 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam222bQ6P539 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam222bQ6P539 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam222bQ6P539 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam222bQ6P539 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam222bQ6P539 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam222bQ6P539 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam222bQ6P539 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam222bQ6P539 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam222bQ6P539 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam222bQ6P539 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam222bQ6P539 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam222bQ6P539 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam222bQ6P539 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam222bQ6P539 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam222bQ6P539 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam222bQ6P539 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam222bQ6P539 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam222bQ6P539 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam222bQ6P539 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam222bQ6P539 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam222bQ6P539 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam222bQ6P539 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam222bQ6P539 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam222bQ6P539 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam222bQ6P539 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam222bQ6P539 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam222bQ6P539 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam222bQ6P539 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam222bQ6P539 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam222bQ6P539 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam222bQ6P539 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam222bQ6P539 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam222bQ6P539 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam222bQ6P539 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam222bQ6P539 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam222bQ6P539 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam222bQ6P539 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam222bQ6P539 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam222bQ6P539 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam222bQ6P539 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam222bQ6P539 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam222bQ6P539 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam222bQ6P539 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam222bQ6P539 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fam222bQ6P539 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam222bQ6P539 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam222bQ6P539 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam222bQ6P539 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam222bQ6P539 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam222bQ6P539 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam222bQ6P539 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam222bQ6P539 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam222bQ6P539 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam222bQ6P539 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam222bQ6P539 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam222bQ6P539 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam222bQ6P539 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam222bQ6P539 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam222bQ6P539 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam222bQ6P539 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam222bQ6P539 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam222bQ6P539 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam222bQ6P539 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam222bQ6P539 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam222bQ6P539 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam222bQ6P539 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam222bQ6P539 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam222bQ6P539 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam222bQ6P539 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam222bQ6P539 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam222bQ6P539 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam222bQ6P539 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam222bQ6P539 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam222bQ6P539 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam222bQ6P539 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms