Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L6

Nsd3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd3Q6P2L6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Nsd3Q6P2L6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
Nsd3Q6P2L6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Nsd3Q6P2L6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Nsd3Q6P2L6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Nsd3Q6P2L6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Nsd3Q6P2L6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Nsd3Q6P2L6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Nsd3Q6P2L6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Nsd3Q6P2L6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Nsd3Q6P2L6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Nsd3Q6P2L6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Nsd3Q6P2L6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Nsd3Q6P2L6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Nsd3Q6P2L6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Nsd3Q6P2L6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Nsd3Q6P2L6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Nsd3Q6P2L6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Nsd3Q6P2L6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Nsd3Q6P2L6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Nsd3Q6P2L6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Nsd3Q6P2L6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Nsd3Q6P2L6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Nsd3Q6P2L6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Nsd3Q6P2L6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Nsd3Q6P2L6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Nsd3Q6P2L6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Nsd3Q6P2L6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Nsd3Q6P2L6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Nsd3Q6P2L6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Nsd3Q6P2L6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Nsd3Q6P2L6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Nsd3Q6P2L6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Nsd3Q6P2L6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Nsd3Q6P2L6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Nsd3Q6P2L6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Nsd3Q6P2L6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Nsd3Q6P2L6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Nsd3Q6P2L6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Nsd3Q6P2L6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Nsd3Q6P2L6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Nsd3Q6P2L6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Nsd3Q6P2L6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Nsd3Q6P2L6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Nsd3Q6P2L6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Nsd3Q6P2L6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Nsd3Q6P2L6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Nsd3Q6P2L6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Nsd3Q6P2L6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Nsd3Q6P2L6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Nsd3Q6P2L6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Nsd3Q6P2L6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Nsd3Q6P2L6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Nsd3Q6P2L6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Nsd3Q6P2L6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Nsd3Q6P2L6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Nsd3Q6P2L6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Nsd3Q6P2L6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Nsd3Q6P2L6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Nsd3Q6P2L6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Nsd3Q6P2L6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Nsd3Q6P2L6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Nsd3Q6P2L6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Nsd3Q6P2L6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Nsd3Q6P2L6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Nsd3Q6P2L6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Nsd3Q6P2L6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Nsd3Q6P2L6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Nsd3Q6P2L6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Nsd3Q6P2L6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Nsd3Q6P2L6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Nsd3Q6P2L6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Nsd3Q6P2L6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Nsd3Q6P2L6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Nsd3Q6P2L6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Nsd3Q6P2L6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Nsd3Q6P2L6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nsd3Q6P2L6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nsd3Q6P2L6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nsd3Q6P2L6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nsd3Q6P2L6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nsd3Q6P2L6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Nsd3Q6P2L6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nsd3Q6P2L6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nsd3Q6P2L6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nsd3Q6P2L6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nsd3Q6P2L6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nsd3Q6P2L6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nsd3Q6P2L6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Nsd3Q6P2L6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Nsd3Q6P2L6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Nsd3Q6P2L6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Nsd3Q6P2L6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Nsd3Q6P2L6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Nsd3Q6P2L6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Nsd3Q6P2L6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Nsd3Q6P2L6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Nsd3Q6P2L6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Nsd3Q6P2L6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Nsd3Q6P2L6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms