Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Slx4Q6P1D7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Slx4Q6P1D7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
Slx4Q6P1D7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Slx4Q6P1D7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Slx4Q6P1D7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC42.57■■■■■ 4.4
Slx4Q6P1D7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Slx4Q6P1D7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Slx4Q6P1D7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
Slx4Q6P1D7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Slx4Q6P1D7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Slx4Q6P1D7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Slx4Q6P1D7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Slx4Q6P1D7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC42.32■■■■■ 4.37
Slx4Q6P1D7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
Slx4Q6P1D7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Slx4Q6P1D7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Slx4Q6P1D7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Slx4Q6P1D7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Slx4Q6P1D7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Slx4Q6P1D7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Slx4Q6P1D7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
Slx4Q6P1D7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Slx4Q6P1D7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Slx4Q6P1D7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Slx4Q6P1D7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Slx4Q6P1D7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Slx4Q6P1D7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
Slx4Q6P1D7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Slx4Q6P1D7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Slx4Q6P1D7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Slx4Q6P1D7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
Slx4Q6P1D7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
Slx4Q6P1D7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Slx4Q6P1D7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
Slx4Q6P1D7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
Slx4Q6P1D7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Slx4Q6P1D7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Slx4Q6P1D7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Slx4Q6P1D7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Slx4Q6P1D7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Slx4Q6P1D7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Slx4Q6P1D7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Slx4Q6P1D7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Slx4Q6P1D7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Slx4Q6P1D7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Slx4Q6P1D7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Slx4Q6P1D7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Slx4Q6P1D7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Slx4Q6P1D7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Slx4Q6P1D7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.3
Slx4Q6P1D7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
Slx4Q6P1D7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Slx4Q6P1D7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Slx4Q6P1D7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Slx4Q6P1D7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Slx4Q6P1D7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Slx4Q6P1D7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Slx4Q6P1D7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Slx4Q6P1D7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Slx4Q6P1D7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
Slx4Q6P1D7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Slx4Q6P1D7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Slx4Q6P1D7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC41.71■■■■■ 4.27
Slx4Q6P1D7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Slx4Q6P1D7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Slx4Q6P1D7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Slx4Q6P1D7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Slx4Q6P1D7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Slx4Q6P1D7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Slx4Q6P1D7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
Slx4Q6P1D7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Slx4Q6P1D7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Slx4Q6P1D7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Slx4Q6P1D7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Slx4Q6P1D7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
Slx4Q6P1D7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Slx4Q6P1D7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Slx4Q6P1D7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Slx4Q6P1D7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Slx4Q6P1D7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Slx4Q6P1D7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Slx4Q6P1D7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Slx4Q6P1D7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Slx4Q6P1D7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
Slx4Q6P1D7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Slx4Q6P1D7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Slx4Q6P1D7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
Slx4Q6P1D7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
Slx4Q6P1D7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Slx4Q6P1D7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Slx4Q6P1D7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Slx4Q6P1D7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Slx4Q6P1D7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Slx4Q6P1D7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Slx4Q6P1D7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Slx4Q6P1D7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Slx4Q6P1D7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Slx4Q6P1D7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Slx4Q6P1D7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms