Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI9

Zfp180, Zinc finger protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp180Q6NZI9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp180Q6NZI9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp180Q6NZI9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp180Q6NZI9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp180Q6NZI9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp180Q6NZI9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp180Q6NZI9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp180Q6NZI9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp180Q6NZI9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp180Q6NZI9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp180Q6NZI9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp180Q6NZI9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zfp180Q6NZI9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp180Q6NZI9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp180Q6NZI9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp180Q6NZI9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp180Q6NZI9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp180Q6NZI9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp180Q6NZI9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp180Q6NZI9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp180Q6NZI9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp180Q6NZI9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp180Q6NZI9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp180Q6NZI9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zfp180Q6NZI9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp180Q6NZI9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp180Q6NZI9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp180Q6NZI9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp180Q6NZI9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp180Q6NZI9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp180Q6NZI9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp180Q6NZI9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp180Q6NZI9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp180Q6NZI9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp180Q6NZI9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp180Q6NZI9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp180Q6NZI9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp180Q6NZI9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp180Q6NZI9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp180Q6NZI9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp180Q6NZI9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp180Q6NZI9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp180Q6NZI9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp180Q6NZI9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp180Q6NZI9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp180Q6NZI9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp180Q6NZI9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp180Q6NZI9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp180Q6NZI9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfp180Q6NZI9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp180Q6NZI9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp180Q6NZI9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp180Q6NZI9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp180Q6NZI9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp180Q6NZI9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp180Q6NZI9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp180Q6NZI9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp180Q6NZI9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp180Q6NZI9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp180Q6NZI9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp180Q6NZI9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp180Q6NZI9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp180Q6NZI9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp180Q6NZI9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp180Q6NZI9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp180Q6NZI9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp180Q6NZI9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp180Q6NZI9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp180Q6NZI9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp180Q6NZI9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp180Q6NZI9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp180Q6NZI9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp180Q6NZI9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp180Q6NZI9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp180Q6NZI9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp180Q6NZI9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp180Q6NZI9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp180Q6NZI9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp180Q6NZI9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp180Q6NZI9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp180Q6NZI9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp180Q6NZI9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp180Q6NZI9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp180Q6NZI9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp180Q6NZI9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp180Q6NZI9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp180Q6NZI9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp180Q6NZI9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp180Q6NZI9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp180Q6NZI9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp180Q6NZI9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp180Q6NZI9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp180Q6NZI9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp180Q6NZI9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp180Q6NZI9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp180Q6NZI9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp180Q6NZI9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp180Q6NZI9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp180Q6NZI9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp180Q6NZI9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms