Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SphkapQ6NSW3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
SphkapQ6NSW3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SphkapQ6NSW3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
SphkapQ6NSW3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SphkapQ6NSW3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SphkapQ6NSW3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SphkapQ6NSW3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SphkapQ6NSW3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
SphkapQ6NSW3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC40.02■■■■■ 4
SphkapQ6NSW3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
SphkapQ6NSW3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC40■■■■□ 3.99
SphkapQ6NSW3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
SphkapQ6NSW3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
SphkapQ6NSW3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
SphkapQ6NSW3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
SphkapQ6NSW3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
SphkapQ6NSW3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
SphkapQ6NSW3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
SphkapQ6NSW3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
SphkapQ6NSW3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SphkapQ6NSW3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
SphkapQ6NSW3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SphkapQ6NSW3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SphkapQ6NSW3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SphkapQ6NSW3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
SphkapQ6NSW3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
SphkapQ6NSW3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.96
SphkapQ6NSW3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
SphkapQ6NSW3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
SphkapQ6NSW3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
SphkapQ6NSW3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
SphkapQ6NSW3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SphkapQ6NSW3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SphkapQ6NSW3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SphkapQ6NSW3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SphkapQ6NSW3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
SphkapQ6NSW3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SphkapQ6NSW3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SphkapQ6NSW3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
SphkapQ6NSW3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SphkapQ6NSW3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SphkapQ6NSW3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
SphkapQ6NSW3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SphkapQ6NSW3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SphkapQ6NSW3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SphkapQ6NSW3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SphkapQ6NSW3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SphkapQ6NSW3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC39.51■■■■□ 3.91
SphkapQ6NSW3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SphkapQ6NSW3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SphkapQ6NSW3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SphkapQ6NSW3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
SphkapQ6NSW3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
SphkapQ6NSW3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SphkapQ6NSW3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
SphkapQ6NSW3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SphkapQ6NSW3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
SphkapQ6NSW3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
SphkapQ6NSW3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
SphkapQ6NSW3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
SphkapQ6NSW3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
SphkapQ6NSW3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
SphkapQ6NSW3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SphkapQ6NSW3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
SphkapQ6NSW3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
SphkapQ6NSW3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SphkapQ6NSW3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
SphkapQ6NSW3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SphkapQ6NSW3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SphkapQ6NSW3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
SphkapQ6NSW3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
SphkapQ6NSW3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SphkapQ6NSW3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SphkapQ6NSW3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SphkapQ6NSW3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SphkapQ6NSW3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SphkapQ6NSW3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SphkapQ6NSW3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
SphkapQ6NSW3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SphkapQ6NSW3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SphkapQ6NSW3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
SphkapQ6NSW3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SphkapQ6NSW3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SphkapQ6NSW3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SphkapQ6NSW3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SphkapQ6NSW3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SphkapQ6NSW3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC39■■■■□ 3.83
SphkapQ6NSW3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SphkapQ6NSW3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SphkapQ6NSW3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SphkapQ6NSW3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SphkapQ6NSW3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SphkapQ6NSW3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SphkapQ6NSW3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
SphkapQ6NSW3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
SphkapQ6NSW3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SphkapQ6NSW3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SphkapQ6NSW3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SphkapQ6NSW3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms