Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tpm4Q6IRU2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tpm4Q6IRU2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tpm4Q6IRU2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tpm4Q6IRU2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tpm4Q6IRU2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Tpm4Q6IRU2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Tpm4Q6IRU2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tpm4Q6IRU2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tpm4Q6IRU2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tpm4Q6IRU2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tpm4Q6IRU2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tpm4Q6IRU2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tpm4Q6IRU2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tpm4Q6IRU2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tpm4Q6IRU2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tpm4Q6IRU2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tpm4Q6IRU2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tpm4Q6IRU2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tpm4Q6IRU2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tpm4Q6IRU2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tpm4Q6IRU2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tpm4Q6IRU2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tpm4Q6IRU2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tpm4Q6IRU2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tpm4Q6IRU2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tpm4Q6IRU2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tpm4Q6IRU2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tpm4Q6IRU2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tpm4Q6IRU2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tpm4Q6IRU2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tpm4Q6IRU2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tpm4Q6IRU2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tpm4Q6IRU2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tpm4Q6IRU2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tpm4Q6IRU2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tpm4Q6IRU2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tpm4Q6IRU2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tpm4Q6IRU2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tpm4Q6IRU2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tpm4Q6IRU2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tpm4Q6IRU2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tpm4Q6IRU2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Tpm4Q6IRU2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tpm4Q6IRU2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tpm4Q6IRU2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tpm4Q6IRU2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tpm4Q6IRU2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tpm4Q6IRU2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tpm4Q6IRU2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tpm4Q6IRU2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tpm4Q6IRU2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tpm4Q6IRU2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tpm4Q6IRU2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tpm4Q6IRU2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tpm4Q6IRU2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tpm4Q6IRU2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tpm4Q6IRU2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpm4Q6IRU2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpm4Q6IRU2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Tpm4Q6IRU2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tpm4Q6IRU2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tpm4Q6IRU2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tpm4Q6IRU2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tpm4Q6IRU2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tpm4Q6IRU2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tpm4Q6IRU2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tpm4Q6IRU2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tpm4Q6IRU2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tpm4Q6IRU2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tpm4Q6IRU2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tpm4Q6IRU2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tpm4Q6IRU2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tpm4Q6IRU2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tpm4Q6IRU2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tpm4Q6IRU2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tpm4Q6IRU2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tpm4Q6IRU2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tpm4Q6IRU2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tpm4Q6IRU2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tpm4Q6IRU2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tpm4Q6IRU2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Tpm4Q6IRU2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tpm4Q6IRU2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tpm4Q6IRU2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tpm4Q6IRU2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tpm4Q6IRU2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tpm4Q6IRU2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tpm4Q6IRU2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tpm4Q6IRU2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tpm4Q6IRU2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tpm4Q6IRU2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tpm4Q6IRU2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tpm4Q6IRU2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tpm4Q6IRU2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tpm4Q6IRU2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tpm4Q6IRU2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tpm4Q6IRU2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tpm4Q6IRU2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms