Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Carmil1Q6EDY6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
Carmil1Q6EDY6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
Carmil1Q6EDY6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Carmil1Q6EDY6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Carmil1Q6EDY6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
Carmil1Q6EDY6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC42.7■■■■■ 4.43
Carmil1Q6EDY6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
Carmil1Q6EDY6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
Carmil1Q6EDY6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Carmil1Q6EDY6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Carmil1Q6EDY6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Carmil1Q6EDY6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
Carmil1Q6EDY6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Carmil1Q6EDY6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Carmil1Q6EDY6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Carmil1Q6EDY6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Carmil1Q6EDY6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Carmil1Q6EDY6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
Carmil1Q6EDY6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Carmil1Q6EDY6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Carmil1Q6EDY6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
Carmil1Q6EDY6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Carmil1Q6EDY6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
Carmil1Q6EDY6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Carmil1Q6EDY6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Carmil1Q6EDY6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Carmil1Q6EDY6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Carmil1Q6EDY6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.35
Carmil1Q6EDY6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Carmil1Q6EDY6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC42.25■■■■■ 4.35
Carmil1Q6EDY6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Carmil1Q6EDY6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
Carmil1Q6EDY6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Carmil1Q6EDY6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Carmil1Q6EDY6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Carmil1Q6EDY6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Carmil1Q6EDY6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Carmil1Q6EDY6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Carmil1Q6EDY6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Carmil1Q6EDY6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Carmil1Q6EDY6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Carmil1Q6EDY6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Carmil1Q6EDY6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Carmil1Q6EDY6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Carmil1Q6EDY6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Carmil1Q6EDY6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Carmil1Q6EDY6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.31
Carmil1Q6EDY6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Carmil1Q6EDY6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Carmil1Q6EDY6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Carmil1Q6EDY6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Carmil1Q6EDY6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Carmil1Q6EDY6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
Carmil1Q6EDY6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.3
Carmil1Q6EDY6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Carmil1Q6EDY6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Carmil1Q6EDY6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Carmil1Q6EDY6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Carmil1Q6EDY6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
Carmil1Q6EDY6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Carmil1Q6EDY6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Carmil1Q6EDY6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Carmil1Q6EDY6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Carmil1Q6EDY6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Carmil1Q6EDY6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
Carmil1Q6EDY6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Carmil1Q6EDY6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Carmil1Q6EDY6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Carmil1Q6EDY6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
Carmil1Q6EDY6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Carmil1Q6EDY6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
Carmil1Q6EDY6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
Carmil1Q6EDY6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
Carmil1Q6EDY6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Carmil1Q6EDY6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Carmil1Q6EDY6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Carmil1Q6EDY6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Carmil1Q6EDY6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Carmil1Q6EDY6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Carmil1Q6EDY6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Carmil1Q6EDY6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Carmil1Q6EDY6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Carmil1Q6EDY6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Carmil1Q6EDY6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Carmil1Q6EDY6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Carmil1Q6EDY6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Carmil1Q6EDY6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Carmil1Q6EDY6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
Carmil1Q6EDY6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Carmil1Q6EDY6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Carmil1Q6EDY6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Carmil1Q6EDY6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Carmil1Q6EDY6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Carmil1Q6EDY6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Carmil1Q6EDY6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Carmil1Q6EDY6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Carmil1Q6EDY6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Carmil1Q6EDY6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms