Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFY8

Brinp2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp2Q6DFY8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brinp2Q6DFY8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brinp2Q6DFY8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brinp2Q6DFY8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brinp2Q6DFY8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brinp2Q6DFY8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brinp2Q6DFY8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brinp2Q6DFY8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brinp2Q6DFY8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Brinp2Q6DFY8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Brinp2Q6DFY8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Brinp2Q6DFY8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brinp2Q6DFY8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brinp2Q6DFY8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brinp2Q6DFY8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brinp2Q6DFY8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brinp2Q6DFY8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brinp2Q6DFY8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brinp2Q6DFY8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brinp2Q6DFY8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brinp2Q6DFY8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brinp2Q6DFY8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brinp2Q6DFY8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brinp2Q6DFY8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brinp2Q6DFY8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brinp2Q6DFY8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Brinp2Q6DFY8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brinp2Q6DFY8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brinp2Q6DFY8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brinp2Q6DFY8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brinp2Q6DFY8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brinp2Q6DFY8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Brinp2Q6DFY8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brinp2Q6DFY8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brinp2Q6DFY8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brinp2Q6DFY8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brinp2Q6DFY8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brinp2Q6DFY8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brinp2Q6DFY8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brinp2Q6DFY8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brinp2Q6DFY8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brinp2Q6DFY8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brinp2Q6DFY8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Brinp2Q6DFY8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brinp2Q6DFY8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Brinp2Q6DFY8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brinp2Q6DFY8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brinp2Q6DFY8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Brinp2Q6DFY8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brinp2Q6DFY8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brinp2Q6DFY8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brinp2Q6DFY8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Brinp2Q6DFY8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Brinp2Q6DFY8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Brinp2Q6DFY8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brinp2Q6DFY8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brinp2Q6DFY8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brinp2Q6DFY8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Brinp2Q6DFY8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brinp2Q6DFY8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brinp2Q6DFY8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brinp2Q6DFY8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brinp2Q6DFY8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Brinp2Q6DFY8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brinp2Q6DFY8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brinp2Q6DFY8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Brinp2Q6DFY8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brinp2Q6DFY8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brinp2Q6DFY8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brinp2Q6DFY8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brinp2Q6DFY8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brinp2Q6DFY8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Brinp2Q6DFY8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brinp2Q6DFY8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brinp2Q6DFY8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brinp2Q6DFY8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brinp2Q6DFY8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brinp2Q6DFY8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brinp2Q6DFY8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brinp2Q6DFY8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brinp2Q6DFY8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Brinp2Q6DFY8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brinp2Q6DFY8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brinp2Q6DFY8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brinp2Q6DFY8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brinp2Q6DFY8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brinp2Q6DFY8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brinp2Q6DFY8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Brinp2Q6DFY8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brinp2Q6DFY8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brinp2Q6DFY8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brinp2Q6DFY8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brinp2Q6DFY8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brinp2Q6DFY8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brinp2Q6DFY8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brinp2Q6DFY8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brinp2Q6DFY8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brinp2Q6DFY8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brinp2Q6DFY8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brinp2Q6DFY8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms