Protein–RNA interactions for Protein: Q64322

Npdc1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npdc1Q64322 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npdc1Q64322 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npdc1Q64322 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npdc1Q64322 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Npdc1Q64322 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npdc1Q64322 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Npdc1Q64322 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npdc1Q64322 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npdc1Q64322 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npdc1Q64322 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npdc1Q64322 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npdc1Q64322 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Npdc1Q64322 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Npdc1Q64322 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Npdc1Q64322 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Npdc1Q64322 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Npdc1Q64322 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Npdc1Q64322 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Npdc1Q64322 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Npdc1Q64322 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Npdc1Q64322 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Npdc1Q64322 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npdc1Q64322 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npdc1Q64322 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npdc1Q64322 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npdc1Q64322 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npdc1Q64322 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npdc1Q64322 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npdc1Q64322 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npdc1Q64322 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npdc1Q64322 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npdc1Q64322 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npdc1Q64322 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npdc1Q64322 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Npdc1Q64322 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Npdc1Q64322 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npdc1Q64322 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Npdc1Q64322 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Npdc1Q64322 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Npdc1Q64322 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Npdc1Q64322 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Npdc1Q64322 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Npdc1Q64322 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npdc1Q64322 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Npdc1Q64322 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npdc1Q64322 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npdc1Q64322 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npdc1Q64322 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npdc1Q64322 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Npdc1Q64322 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Npdc1Q64322 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Npdc1Q64322 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npdc1Q64322 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Npdc1Q64322 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npdc1Q64322 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npdc1Q64322 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npdc1Q64322 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Npdc1Q64322 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npdc1Q64322 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npdc1Q64322 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npdc1Q64322 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npdc1Q64322 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npdc1Q64322 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npdc1Q64322 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npdc1Q64322 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npdc1Q64322 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npdc1Q64322 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npdc1Q64322 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npdc1Q64322 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Npdc1Q64322 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npdc1Q64322 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npdc1Q64322 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npdc1Q64322 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npdc1Q64322 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npdc1Q64322 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Npdc1Q64322 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npdc1Q64322 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npdc1Q64322 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npdc1Q64322 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Npdc1Q64322 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Npdc1Q64322 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Npdc1Q64322 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Npdc1Q64322 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Npdc1Q64322 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Npdc1Q64322 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Npdc1Q64322 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Npdc1Q64322 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Npdc1Q64322 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npdc1Q64322 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npdc1Q64322 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Npdc1Q64322 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npdc1Q64322 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npdc1Q64322 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Npdc1Q64322 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Npdc1Q64322 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npdc1Q64322 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npdc1Q64322 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npdc1Q64322 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npdc1Q64322 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npdc1Q64322 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms