Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt12Q64291 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt12Q64291 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt12Q64291 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt12Q64291 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt12Q64291 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Krt12Q64291 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt12Q64291 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt12Q64291 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Krt12Q64291 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt12Q64291 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt12Q64291 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt12Q64291 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt12Q64291 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt12Q64291 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt12Q64291 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt12Q64291 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt12Q64291 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt12Q64291 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt12Q64291 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt12Q64291 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt12Q64291 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt12Q64291 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt12Q64291 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt12Q64291 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt12Q64291 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt12Q64291 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt12Q64291 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt12Q64291 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt12Q64291 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt12Q64291 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krt12Q64291 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt12Q64291 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt12Q64291 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt12Q64291 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt12Q64291 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt12Q64291 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt12Q64291 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt12Q64291 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt12Q64291 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt12Q64291 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt12Q64291 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt12Q64291 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt12Q64291 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt12Q64291 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt12Q64291 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt12Q64291 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Krt12Q64291 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt12Q64291 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt12Q64291 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krt12Q64291 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt12Q64291 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Krt12Q64291 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt12Q64291 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt12Q64291 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt12Q64291 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt12Q64291 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Krt12Q64291 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Krt12Q64291 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Krt12Q64291 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Krt12Q64291 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Krt12Q64291 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Krt12Q64291 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Krt12Q64291 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Krt12Q64291 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt12Q64291 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt12Q64291 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt12Q64291 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt12Q64291 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt12Q64291 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt12Q64291 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt12Q64291 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt12Q64291 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt12Q64291 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt12Q64291 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt12Q64291 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt12Q64291 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Krt12Q64291 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt12Q64291 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krt12Q64291 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt12Q64291 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt12Q64291 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt12Q64291 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt12Q64291 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt12Q64291 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Krt12Q64291 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt12Q64291 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt12Q64291 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt12Q64291 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt12Q64291 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt12Q64291 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt12Q64291 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt12Q64291 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Krt12Q64291 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt12Q64291 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt12Q64291 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt12Q64291 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt12Q64291 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt12Q64291 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt12Q64291 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms