Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pan3Q640Q5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pan3Q640Q5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pan3Q640Q5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pan3Q640Q5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pan3Q640Q5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pan3Q640Q5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pan3Q640Q5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pan3Q640Q5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pan3Q640Q5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pan3Q640Q5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pan3Q640Q5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pan3Q640Q5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pan3Q640Q5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pan3Q640Q5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pan3Q640Q5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pan3Q640Q5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pan3Q640Q5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pan3Q640Q5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pan3Q640Q5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pan3Q640Q5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pan3Q640Q5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pan3Q640Q5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pan3Q640Q5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pan3Q640Q5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pan3Q640Q5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pan3Q640Q5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pan3Q640Q5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pan3Q640Q5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pan3Q640Q5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pan3Q640Q5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pan3Q640Q5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pan3Q640Q5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pan3Q640Q5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pan3Q640Q5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pan3Q640Q5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pan3Q640Q5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pan3Q640Q5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pan3Q640Q5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pan3Q640Q5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pan3Q640Q5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pan3Q640Q5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pan3Q640Q5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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