Protein–RNA interactions for Protein: Q640N2

Arl13b, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl13bQ640N2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Arl13bQ640N2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Arl13bQ640N2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Arl13bQ640N2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Arl13bQ640N2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Arl13bQ640N2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Arl13bQ640N2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Arl13bQ640N2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Arl13bQ640N2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Arl13bQ640N2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Arl13bQ640N2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Arl13bQ640N2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Arl13bQ640N2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Arl13bQ640N2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Arl13bQ640N2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Arl13bQ640N2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Arl13bQ640N2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Arl13bQ640N2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Arl13bQ640N2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Arl13bQ640N2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Arl13bQ640N2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Arl13bQ640N2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Arl13bQ640N2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Arl13bQ640N2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Arl13bQ640N2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Arl13bQ640N2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Arl13bQ640N2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Arl13bQ640N2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Arl13bQ640N2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Arl13bQ640N2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Arl13bQ640N2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arl13bQ640N2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Arl13bQ640N2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arl13bQ640N2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arl13bQ640N2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Arl13bQ640N2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Arl13bQ640N2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arl13bQ640N2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Arl13bQ640N2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arl13bQ640N2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arl13bQ640N2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arl13bQ640N2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arl13bQ640N2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arl13bQ640N2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arl13bQ640N2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arl13bQ640N2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arl13bQ640N2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arl13bQ640N2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arl13bQ640N2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Arl13bQ640N2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arl13bQ640N2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arl13bQ640N2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arl13bQ640N2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arl13bQ640N2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arl13bQ640N2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arl13bQ640N2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arl13bQ640N2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arl13bQ640N2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arl13bQ640N2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Arl13bQ640N2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arl13bQ640N2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arl13bQ640N2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arl13bQ640N2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arl13bQ640N2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arl13bQ640N2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arl13bQ640N2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arl13bQ640N2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arl13bQ640N2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Arl13bQ640N2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Arl13bQ640N2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Arl13bQ640N2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Arl13bQ640N2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arl13bQ640N2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arl13bQ640N2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arl13bQ640N2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arl13bQ640N2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Arl13bQ640N2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arl13bQ640N2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Arl13bQ640N2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Arl13bQ640N2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Arl13bQ640N2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Arl13bQ640N2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arl13bQ640N2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arl13bQ640N2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arl13bQ640N2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arl13bQ640N2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arl13bQ640N2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arl13bQ640N2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arl13bQ640N2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arl13bQ640N2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arl13bQ640N2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arl13bQ640N2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arl13bQ640N2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arl13bQ640N2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arl13bQ640N2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Arl13bQ640N2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arl13bQ640N2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Arl13bQ640N2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arl13bQ640N2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arl13bQ640N2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms