Protein–RNA interactions for Protein: Q62376

Snrnp70, U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp70Q62376 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp70Q62376 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp70Q62376 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrnp70Q62376 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrnp70Q62376 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrnp70Q62376 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp70Q62376 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrnp70Q62376 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp70Q62376 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp70Q62376 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrnp70Q62376 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp70Q62376 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp70Q62376 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp70Q62376 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp70Q62376 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp70Q62376 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp70Q62376 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp70Q62376 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrnp70Q62376 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp70Q62376 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp70Q62376 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp70Q62376 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp70Q62376 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp70Q62376 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrnp70Q62376 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrnp70Q62376 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp70Q62376 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp70Q62376 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrnp70Q62376 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrnp70Q62376 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp70Q62376 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp70Q62376 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snrnp70Q62376 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp70Q62376 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp70Q62376 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp70Q62376 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrnp70Q62376 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrnp70Q62376 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrnp70Q62376 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrnp70Q62376 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrnp70Q62376 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp70Q62376 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp70Q62376 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp70Q62376 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp70Q62376 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp70Q62376 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp70Q62376 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Snrnp70Q62376 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp70Q62376 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp70Q62376 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp70Q62376 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp70Q62376 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp70Q62376 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp70Q62376 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp70Q62376 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrnp70Q62376 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp70Q62376 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp70Q62376 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snrnp70Q62376 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snrnp70Q62376 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp70Q62376 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp70Q62376 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp70Q62376 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp70Q62376 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp70Q62376 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp70Q62376 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp70Q62376 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp70Q62376 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp70Q62376 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp70Q62376 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp70Q62376 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrnp70Q62376 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp70Q62376 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp70Q62376 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp70Q62376 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp70Q62376 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp70Q62376 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrnp70Q62376 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp70Q62376 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp70Q62376 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp70Q62376 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp70Q62376 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp70Q62376 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp70Q62376 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrnp70Q62376 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrnp70Q62376 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp70Q62376 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp70Q62376 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp70Q62376 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp70Q62376 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp70Q62376 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp70Q62376 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp70Q62376 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp70Q62376 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp70Q62376 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp70Q62376 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms