Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf6Q62311 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf6Q62311 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf6Q62311 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf6Q62311 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf6Q62311 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf6Q62311 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf6Q62311 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf6Q62311 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf6Q62311 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf6Q62311 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf6Q62311 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf6Q62311 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf6Q62311 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf6Q62311 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf6Q62311 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf6Q62311 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf6Q62311 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf6Q62311 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf6Q62311 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf6Q62311 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf6Q62311 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf6Q62311 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf6Q62311 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf6Q62311 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf6Q62311 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf6Q62311 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf6Q62311 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf6Q62311 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf6Q62311 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf6Q62311 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf6Q62311 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf6Q62311 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf6Q62311 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf6Q62311 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf6Q62311 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf6Q62311 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf6Q62311 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf6Q62311 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf6Q62311 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf6Q62311 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf6Q62311 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf6Q62311 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf6Q62311 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf6Q62311 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf6Q62311 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf6Q62311 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf6Q62311 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf6Q62311 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf6Q62311 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf6Q62311 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf6Q62311 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf6Q62311 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf6Q62311 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf6Q62311 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf6Q62311 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf6Q62311 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf6Q62311 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf6Q62311 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf6Q62311 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf6Q62311 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf6Q62311 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf6Q62311 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf6Q62311 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf6Q62311 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf6Q62311 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf6Q62311 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf6Q62311 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf6Q62311 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf6Q62311 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Taf6Q62311 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf6Q62311 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf6Q62311 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf6Q62311 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf6Q62311 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf6Q62311 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf6Q62311 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf6Q62311 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf6Q62311 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf6Q62311 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf6Q62311 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf6Q62311 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf6Q62311 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf6Q62311 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf6Q62311 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf6Q62311 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf6Q62311 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf6Q62311 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf6Q62311 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf6Q62311 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf6Q62311 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf6Q62311 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf6Q62311 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf6Q62311 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf6Q62311 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf6Q62311 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf6Q62311 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf6Q62311 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf6Q62311 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf6Q62311 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms