Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox19Q62249 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox19Q62249 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox19Q62249 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sox19Q62249 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox19Q62249 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox19Q62249 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox19Q62249 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox19Q62249 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox19Q62249 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox19Q62249 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox19Q62249 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox19Q62249 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox19Q62249 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox19Q62249 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox19Q62249 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox19Q62249 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox19Q62249 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox19Q62249 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox19Q62249 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox19Q62249 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox19Q62249 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox19Q62249 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox19Q62249 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox19Q62249 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox19Q62249 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox19Q62249 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox19Q62249 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox19Q62249 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sox19Q62249 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox19Q62249 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox19Q62249 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox19Q62249 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox19Q62249 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox19Q62249 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox19Q62249 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox19Q62249 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox19Q62249 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox19Q62249 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox19Q62249 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox19Q62249 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox19Q62249 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox19Q62249 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox19Q62249 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox19Q62249 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox19Q62249 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox19Q62249 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox19Q62249 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox19Q62249 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox19Q62249 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox19Q62249 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox19Q62249 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox19Q62249 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox19Q62249 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox19Q62249 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox19Q62249 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox19Q62249 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox19Q62249 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox19Q62249 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox19Q62249 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox19Q62249 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox19Q62249 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox19Q62249 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox19Q62249 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox19Q62249 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox19Q62249 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox19Q62249 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox19Q62249 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox19Q62249 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox19Q62249 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox19Q62249 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox19Q62249 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox19Q62249 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox19Q62249 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox19Q62249 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox19Q62249 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox19Q62249 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox19Q62249 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox19Q62249 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox19Q62249 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox19Q62249 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox19Q62249 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox19Q62249 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox19Q62249 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox19Q62249 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox19Q62249 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox19Q62249 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox19Q62249 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox19Q62249 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox19Q62249 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox19Q62249 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox19Q62249 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox19Q62249 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox19Q62249 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox19Q62249 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox19Q62249 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox19Q62249 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox19Q62249 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox19Q62249 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox19Q62249 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms