Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttf1Q62187 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttf1Q62187 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttf1Q62187 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttf1Q62187 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttf1Q62187 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttf1Q62187 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttf1Q62187 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttf1Q62187 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttf1Q62187 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttf1Q62187 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttf1Q62187 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttf1Q62187 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttf1Q62187 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttf1Q62187 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttf1Q62187 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttf1Q62187 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttf1Q62187 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttf1Q62187 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttf1Q62187 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttf1Q62187 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttf1Q62187 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttf1Q62187 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttf1Q62187 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttf1Q62187 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttf1Q62187 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttf1Q62187 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttf1Q62187 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttf1Q62187 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttf1Q62187 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttf1Q62187 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttf1Q62187 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttf1Q62187 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttf1Q62187 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttf1Q62187 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttf1Q62187 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttf1Q62187 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttf1Q62187 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttf1Q62187 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttf1Q62187 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttf1Q62187 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttf1Q62187 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttf1Q62187 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttf1Q62187 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttf1Q62187 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttf1Q62187 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttf1Q62187 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttf1Q62187 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttf1Q62187 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttf1Q62187 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttf1Q62187 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttf1Q62187 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttf1Q62187 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttf1Q62187 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttf1Q62187 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttf1Q62187 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttf1Q62187 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttf1Q62187 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttf1Q62187 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttf1Q62187 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttf1Q62187 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttf1Q62187 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttf1Q62187 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttf1Q62187 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttf1Q62187 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttf1Q62187 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttf1Q62187 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttf1Q62187 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttf1Q62187 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttf1Q62187 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttf1Q62187 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttf1Q62187 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttf1Q62187 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttf1Q62187 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttf1Q62187 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttf1Q62187 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttf1Q62187 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttf1Q62187 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttf1Q62187 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttf1Q62187 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttf1Q62187 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttf1Q62187 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttf1Q62187 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttf1Q62187 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttf1Q62187 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttf1Q62187 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttf1Q62187 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttf1Q62187 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttf1Q62187 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttf1Q62187 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttf1Q62187 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttf1Q62187 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttf1Q62187 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttf1Q62187 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttf1Q62187 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttf1Q62187 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttf1Q62187 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttf1Q62187 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttf1Q62187 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttf1Q62187 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms