Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Aldh1a2Q62148 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Aldh1a2Q62148 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Aldh1a2Q62148 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Aldh1a2Q62148 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aldh1a2Q62148 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aldh1a2Q62148 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aldh1a2Q62148 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aldh1a2Q62148 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aldh1a2Q62148 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aldh1a2Q62148 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aldh1a2Q62148 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aldh1a2Q62148 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aldh1a2Q62148 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aldh1a2Q62148 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Aldh1a2Q62148 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Aldh1a2Q62148 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Aldh1a2Q62148 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Aldh1a2Q62148 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Aldh1a2Q62148 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Aldh1a2Q62148 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Aldh1a2Q62148 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Aldh1a2Q62148 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Aldh1a2Q62148 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Aldh1a2Q62148 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Aldh1a2Q62148 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Aldh1a2Q62148 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Aldh1a2Q62148 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Aldh1a2Q62148 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Aldh1a2Q62148 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Aldh1a2Q62148 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Aldh1a2Q62148 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aldh1a2Q62148 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Aldh1a2Q62148 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Aldh1a2Q62148 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Aldh1a2Q62148 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Aldh1a2Q62148 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Aldh1a2Q62148 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Aldh1a2Q62148 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Aldh1a2Q62148 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Aldh1a2Q62148 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Aldh1a2Q62148 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Aldh1a2Q62148 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Aldh1a2Q62148 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Aldh1a2Q62148 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Aldh1a2Q62148 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Aldh1a2Q62148 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Aldh1a2Q62148 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Aldh1a2Q62148 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Aldh1a2Q62148 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Aldh1a2Q62148 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Aldh1a2Q62148 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Aldh1a2Q62148 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Aldh1a2Q62148 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Aldh1a2Q62148 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Aldh1a2Q62148 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Aldh1a2Q62148 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Aldh1a2Q62148 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Aldh1a2Q62148 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Aldh1a2Q62148 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Aldh1a2Q62148 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Aldh1a2Q62148 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Aldh1a2Q62148 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Aldh1a2Q62148 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Aldh1a2Q62148 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Aldh1a2Q62148 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Aldh1a2Q62148 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Aldh1a2Q62148 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Aldh1a2Q62148 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Aldh1a2Q62148 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Aldh1a2Q62148 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Aldh1a2Q62148 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Aldh1a2Q62148 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Aldh1a2Q62148 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Aldh1a2Q62148 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Aldh1a2Q62148 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Aldh1a2Q62148 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Aldh1a2Q62148 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Aldh1a2Q62148 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Aldh1a2Q62148 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Aldh1a2Q62148 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Aldh1a2Q62148 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Aldh1a2Q62148 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Aldh1a2Q62148 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Aldh1a2Q62148 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Aldh1a2Q62148 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Aldh1a2Q62148 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Aldh1a2Q62148 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Aldh1a2Q62148 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Aldh1a2Q62148 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Aldh1a2Q62148 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Aldh1a2Q62148 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Aldh1a2Q62148 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Aldh1a2Q62148 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Aldh1a2Q62148 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Aldh1a2Q62148 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Aldh1a2Q62148 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Aldh1a2Q62148 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aldh1a2Q62148 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aldh1a2Q62148 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.7 ms