Protein–RNA interactions for Protein: Q61810

Ltbp3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp3Q61810 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ltbp3Q61810 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ltbp3Q61810 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ltbp3Q61810 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ltbp3Q61810 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ltbp3Q61810 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ltbp3Q61810 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ltbp3Q61810 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ltbp3Q61810 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ltbp3Q61810 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ltbp3Q61810 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ltbp3Q61810 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ltbp3Q61810 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ltbp3Q61810 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ltbp3Q61810 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ltbp3Q61810 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ltbp3Q61810 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ltbp3Q61810 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ltbp3Q61810 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ltbp3Q61810 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ltbp3Q61810 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ltbp3Q61810 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ltbp3Q61810 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ltbp3Q61810 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ltbp3Q61810 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ltbp3Q61810 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ltbp3Q61810 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ltbp3Q61810 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ltbp3Q61810 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ltbp3Q61810 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ltbp3Q61810 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ltbp3Q61810 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ltbp3Q61810 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ltbp3Q61810 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ltbp3Q61810 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ltbp3Q61810 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ltbp3Q61810 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ltbp3Q61810 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ltbp3Q61810 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ltbp3Q61810 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ltbp3Q61810 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ltbp3Q61810 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ltbp3Q61810 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ltbp3Q61810 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ltbp3Q61810 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ltbp3Q61810 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ltbp3Q61810 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ltbp3Q61810 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ltbp3Q61810 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ltbp3Q61810 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ltbp3Q61810 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ltbp3Q61810 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ltbp3Q61810 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ltbp3Q61810 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ltbp3Q61810 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ltbp3Q61810 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ltbp3Q61810 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ltbp3Q61810 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ltbp3Q61810 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ltbp3Q61810 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ltbp3Q61810 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ltbp3Q61810 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ltbp3Q61810 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ltbp3Q61810 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ltbp3Q61810 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ltbp3Q61810 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ltbp3Q61810 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ltbp3Q61810 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ltbp3Q61810 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ltbp3Q61810 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ltbp3Q61810 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ltbp3Q61810 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp3Q61810 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp3Q61810 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ltbp3Q61810 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ltbp3Q61810 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ltbp3Q61810 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ltbp3Q61810 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltbp3Q61810 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltbp3Q61810 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltbp3Q61810 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ltbp3Q61810 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ltbp3Q61810 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ltbp3Q61810 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ltbp3Q61810 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltbp3Q61810 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltbp3Q61810 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltbp3Q61810 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ltbp3Q61810 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ltbp3Q61810 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ltbp3Q61810 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ltbp3Q61810 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ltbp3Q61810 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ltbp3Q61810 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ltbp3Q61810 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ltbp3Q61810 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ltbp3Q61810 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ltbp3Q61810 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltbp3Q61810 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ltbp3Q61810 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms