Protein–RNA interactions for Protein: Q61645

Hr, Lysine-specific demethylase hairless, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrQ61645 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
HrQ61645 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HrQ61645 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HrQ61645 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HrQ61645 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HrQ61645 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HrQ61645 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HrQ61645 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HrQ61645 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HrQ61645 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HrQ61645 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HrQ61645 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HrQ61645 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HrQ61645 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HrQ61645 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HrQ61645 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HrQ61645 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HrQ61645 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HrQ61645 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HrQ61645 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HrQ61645 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HrQ61645 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HrQ61645 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HrQ61645 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HrQ61645 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HrQ61645 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HrQ61645 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HrQ61645 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HrQ61645 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HrQ61645 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HrQ61645 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HrQ61645 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HrQ61645 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HrQ61645 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HrQ61645 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HrQ61645 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HrQ61645 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HrQ61645 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HrQ61645 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrQ61645 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HrQ61645 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HrQ61645 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HrQ61645 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HrQ61645 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HrQ61645 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HrQ61645 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HrQ61645 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HrQ61645 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HrQ61645 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HrQ61645 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HrQ61645 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HrQ61645 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HrQ61645 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HrQ61645 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HrQ61645 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HrQ61645 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HrQ61645 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HrQ61645 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HrQ61645 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HrQ61645 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HrQ61645 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HrQ61645 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HrQ61645 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
HrQ61645 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HrQ61645 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HrQ61645 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HrQ61645 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HrQ61645 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HrQ61645 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HrQ61645 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HrQ61645 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HrQ61645 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HrQ61645 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HrQ61645 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HrQ61645 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HrQ61645 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HrQ61645 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HrQ61645 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HrQ61645 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HrQ61645 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HrQ61645 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HrQ61645 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HrQ61645 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HrQ61645 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HrQ61645 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HrQ61645 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HrQ61645 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HrQ61645 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HrQ61645 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HrQ61645 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HrQ61645 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HrQ61645 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrQ61645 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrQ61645 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HrQ61645 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HrQ61645 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HrQ61645 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HrQ61645 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HrQ61645 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HrQ61645 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms