Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ccna1Q61456 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccna1Q61456 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccna1Q61456 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccna1Q61456 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccna1Q61456 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccna1Q61456 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccna1Q61456 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccna1Q61456 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccna1Q61456 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccna1Q61456 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccna1Q61456 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccna1Q61456 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccna1Q61456 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccna1Q61456 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccna1Q61456 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccna1Q61456 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccna1Q61456 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccna1Q61456 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccna1Q61456 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccna1Q61456 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccna1Q61456 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccna1Q61456 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccna1Q61456 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccna1Q61456 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccna1Q61456 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccna1Q61456 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccna1Q61456 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccna1Q61456 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccna1Q61456 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccna1Q61456 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccna1Q61456 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccna1Q61456 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccna1Q61456 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccna1Q61456 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccna1Q61456 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccna1Q61456 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccna1Q61456 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccna1Q61456 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccna1Q61456 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccna1Q61456 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccna1Q61456 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccna1Q61456 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccna1Q61456 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccna1Q61456 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccna1Q61456 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccna1Q61456 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccna1Q61456 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccna1Q61456 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccna1Q61456 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccna1Q61456 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccna1Q61456 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccna1Q61456 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccna1Q61456 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccna1Q61456 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccna1Q61456 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccna1Q61456 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccna1Q61456 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccna1Q61456 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccna1Q61456 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccna1Q61456 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccna1Q61456 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccna1Q61456 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccna1Q61456 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccna1Q61456 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccna1Q61456 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccna1Q61456 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccna1Q61456 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccna1Q61456 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccna1Q61456 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccna1Q61456 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccna1Q61456 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccna1Q61456 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccna1Q61456 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccna1Q61456 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccna1Q61456 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccna1Q61456 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccna1Q61456 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccna1Q61456 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccna1Q61456 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccna1Q61456 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccna1Q61456 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccna1Q61456 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms