Protein–RNA interactions for Protein: Q61011

Gnb3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb3Q61011 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gnb3Q61011 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gnb3Q61011 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gnb3Q61011 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gnb3Q61011 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gnb3Q61011 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gnb3Q61011 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gnb3Q61011 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gnb3Q61011 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gnb3Q61011 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gnb3Q61011 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gnb3Q61011 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gnb3Q61011 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gnb3Q61011 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gnb3Q61011 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gnb3Q61011 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gnb3Q61011 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gnb3Q61011 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gnb3Q61011 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gnb3Q61011 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gnb3Q61011 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gnb3Q61011 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gnb3Q61011 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gnb3Q61011 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gnb3Q61011 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gnb3Q61011 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gnb3Q61011 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gnb3Q61011 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gnb3Q61011 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gnb3Q61011 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gnb3Q61011 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gnb3Q61011 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gnb3Q61011 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gnb3Q61011 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gnb3Q61011 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gnb3Q61011 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gnb3Q61011 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gnb3Q61011 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gnb3Q61011 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gnb3Q61011 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gnb3Q61011 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gnb3Q61011 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gnb3Q61011 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gnb3Q61011 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gnb3Q61011 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gnb3Q61011 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gnb3Q61011 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gnb3Q61011 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gnb3Q61011 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gnb3Q61011 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gnb3Q61011 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gnb3Q61011 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gnb3Q61011 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gnb3Q61011 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gnb3Q61011 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gnb3Q61011 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gnb3Q61011 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gnb3Q61011 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gnb3Q61011 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gnb3Q61011 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gnb3Q61011 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gnb3Q61011 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gnb3Q61011 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gnb3Q61011 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gnb3Q61011 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gnb3Q61011 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gnb3Q61011 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gnb3Q61011 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gnb3Q61011 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gnb3Q61011 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gnb3Q61011 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gnb3Q61011 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gnb3Q61011 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gnb3Q61011 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gnb3Q61011 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gnb3Q61011 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gnb3Q61011 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gnb3Q61011 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gnb3Q61011 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gnb3Q61011 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gnb3Q61011 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gnb3Q61011 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gnb3Q61011 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gnb3Q61011 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gnb3Q61011 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gnb3Q61011 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gnb3Q61011 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gnb3Q61011 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gnb3Q61011 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gnb3Q61011 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gnb3Q61011 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gnb3Q61011 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gnb3Q61011 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gnb3Q61011 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gnb3Q61011 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gnb3Q61011 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gnb3Q61011 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gnb3Q61011 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gnb3Q61011 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gnb3Q61011 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms