Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc125Q5U465 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc125Q5U465 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc125Q5U465 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc125Q5U465 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc125Q5U465 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc125Q5U465 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc125Q5U465 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc125Q5U465 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc125Q5U465 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc125Q5U465 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc125Q5U465 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc125Q5U465 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc125Q5U465 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc125Q5U465 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc125Q5U465 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc125Q5U465 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc125Q5U465 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc125Q5U465 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc125Q5U465 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc125Q5U465 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc125Q5U465 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc125Q5U465 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc125Q5U465 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc125Q5U465 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc125Q5U465 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc125Q5U465 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc125Q5U465 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc125Q5U465 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc125Q5U465 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc125Q5U465 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc125Q5U465 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc125Q5U465 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc125Q5U465 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc125Q5U465 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc125Q5U465 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc125Q5U465 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc125Q5U465 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc125Q5U465 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc125Q5U465 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc125Q5U465 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc125Q5U465 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc125Q5U465 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc125Q5U465 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc125Q5U465 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc125Q5U465 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc125Q5U465 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc125Q5U465 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc125Q5U465 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc125Q5U465 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc125Q5U465 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc125Q5U465 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc125Q5U465 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc125Q5U465 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc125Q5U465 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc125Q5U465 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc125Q5U465 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc125Q5U465 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc125Q5U465 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc125Q5U465 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc125Q5U465 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc125Q5U465 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc125Q5U465 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc125Q5U465 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc125Q5U465 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc125Q5U465 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc125Q5U465 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc125Q5U465 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc125Q5U465 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc125Q5U465 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc125Q5U465 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc125Q5U465 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc125Q5U465 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms