Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SynrgQ5SV85 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SynrgQ5SV85 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SynrgQ5SV85 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SynrgQ5SV85 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SynrgQ5SV85 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SynrgQ5SV85 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SynrgQ5SV85 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SynrgQ5SV85 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SynrgQ5SV85 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SynrgQ5SV85 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SynrgQ5SV85 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SynrgQ5SV85 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SynrgQ5SV85 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SynrgQ5SV85 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SynrgQ5SV85 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SynrgQ5SV85 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SynrgQ5SV85 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SynrgQ5SV85 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SynrgQ5SV85 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SynrgQ5SV85 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SynrgQ5SV85 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SynrgQ5SV85 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SynrgQ5SV85 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SynrgQ5SV85 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SynrgQ5SV85 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SynrgQ5SV85 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SynrgQ5SV85 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SynrgQ5SV85 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SynrgQ5SV85 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SynrgQ5SV85 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SynrgQ5SV85 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SynrgQ5SV85 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SynrgQ5SV85 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SynrgQ5SV85 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SynrgQ5SV85 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SynrgQ5SV85 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SynrgQ5SV85 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SynrgQ5SV85 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SynrgQ5SV85 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SynrgQ5SV85 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SynrgQ5SV85 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SynrgQ5SV85 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SynrgQ5SV85 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SynrgQ5SV85 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SynrgQ5SV85 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SynrgQ5SV85 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SynrgQ5SV85 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SynrgQ5SV85 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SynrgQ5SV85 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SynrgQ5SV85 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SynrgQ5SV85 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SynrgQ5SV85 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SynrgQ5SV85 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SynrgQ5SV85 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SynrgQ5SV85 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SynrgQ5SV85 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SynrgQ5SV85 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SynrgQ5SV85 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SynrgQ5SV85 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SynrgQ5SV85 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SynrgQ5SV85 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SynrgQ5SV85 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SynrgQ5SV85 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SynrgQ5SV85 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SynrgQ5SV85 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SynrgQ5SV85 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SynrgQ5SV85 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SynrgQ5SV85 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SynrgQ5SV85 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SynrgQ5SV85 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SynrgQ5SV85 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SynrgQ5SV85 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SynrgQ5SV85 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SynrgQ5SV85 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SynrgQ5SV85 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SynrgQ5SV85 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SynrgQ5SV85 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SynrgQ5SV85 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SynrgQ5SV85 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SynrgQ5SV85 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SynrgQ5SV85 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SynrgQ5SV85 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SynrgQ5SV85 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SynrgQ5SV85 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SynrgQ5SV85 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SynrgQ5SV85 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SynrgQ5SV85 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SynrgQ5SV85 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SynrgQ5SV85 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SynrgQ5SV85 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SynrgQ5SV85 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SynrgQ5SV85 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SynrgQ5SV85 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SynrgQ5SV85 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SynrgQ5SV85 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SynrgQ5SV85 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SynrgQ5SV85 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SynrgQ5SV85 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SynrgQ5SV85 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 286 ms