Protein–RNA interactions for Protein: Q5G866

Defa23, Alpha-defensin 23, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa23Q5G866 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa23Q5G866 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa23Q5G866 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa23Q5G866 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa23Q5G866 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa23Q5G866 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa23Q5G866 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa23Q5G866 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa23Q5G866 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa23Q5G866 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa23Q5G866 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa23Q5G866 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa23Q5G866 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa23Q5G866 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa23Q5G866 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa23Q5G866 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa23Q5G866 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa23Q5G866 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa23Q5G866 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa23Q5G866 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa23Q5G866 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa23Q5G866 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa23Q5G866 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa23Q5G866 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa23Q5G866 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa23Q5G866 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa23Q5G866 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa23Q5G866 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa23Q5G866 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa23Q5G866 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa23Q5G866 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa23Q5G866 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa23Q5G866 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa23Q5G866 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa23Q5G866 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa23Q5G866 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa23Q5G866 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa23Q5G866 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa23Q5G866 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa23Q5G866 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa23Q5G866 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa23Q5G866 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa23Q5G866 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa23Q5G866 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa23Q5G866 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa23Q5G866 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa23Q5G866 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa23Q5G866 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa23Q5G866 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa23Q5G866 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa23Q5G866 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa23Q5G866 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa23Q5G866 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Defa23Q5G866 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa23Q5G866 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa23Q5G866 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa23Q5G866 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa23Q5G866 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa23Q5G866 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa23Q5G866 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa23Q5G866 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa23Q5G866 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa23Q5G866 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa23Q5G866 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa23Q5G866 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa23Q5G866 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa23Q5G866 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa23Q5G866 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa23Q5G866 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa23Q5G866 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa23Q5G866 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa23Q5G866 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa23Q5G866 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa23Q5G866 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa23Q5G866 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa23Q5G866 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa23Q5G866 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa23Q5G866 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa23Q5G866 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa23Q5G866 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa23Q5G866 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa23Q5G866 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa23Q5G866 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa23Q5G866 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa23Q5G866 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa23Q5G866 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms