Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SynaQ5G5D5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SynaQ5G5D5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SynaQ5G5D5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SynaQ5G5D5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SynaQ5G5D5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SynaQ5G5D5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SynaQ5G5D5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SynaQ5G5D5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SynaQ5G5D5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SynaQ5G5D5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SynaQ5G5D5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SynaQ5G5D5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SynaQ5G5D5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SynaQ5G5D5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SynaQ5G5D5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SynaQ5G5D5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SynaQ5G5D5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SynaQ5G5D5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SynaQ5G5D5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SynaQ5G5D5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SynaQ5G5D5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SynaQ5G5D5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SynaQ5G5D5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SynaQ5G5D5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SynaQ5G5D5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SynaQ5G5D5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SynaQ5G5D5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SynaQ5G5D5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SynaQ5G5D5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SynaQ5G5D5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SynaQ5G5D5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SynaQ5G5D5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SynaQ5G5D5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SynaQ5G5D5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SynaQ5G5D5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SynaQ5G5D5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SynaQ5G5D5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SynaQ5G5D5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SynaQ5G5D5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SynaQ5G5D5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SynaQ5G5D5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SynaQ5G5D5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SynaQ5G5D5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SynaQ5G5D5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SynaQ5G5D5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SynaQ5G5D5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SynaQ5G5D5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SynaQ5G5D5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SynaQ5G5D5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SynaQ5G5D5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SynaQ5G5D5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SynaQ5G5D5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SynaQ5G5D5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SynaQ5G5D5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SynaQ5G5D5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SynaQ5G5D5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SynaQ5G5D5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SynaQ5G5D5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SynaQ5G5D5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SynaQ5G5D5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SynaQ5G5D5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SynaQ5G5D5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SynaQ5G5D5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SynaQ5G5D5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SynaQ5G5D5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SynaQ5G5D5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SynaQ5G5D5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SynaQ5G5D5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SynaQ5G5D5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SynaQ5G5D5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SynaQ5G5D5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SynaQ5G5D5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SynaQ5G5D5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SynaQ5G5D5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SynaQ5G5D5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SynaQ5G5D5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SynaQ5G5D5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SynaQ5G5D5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SynaQ5G5D5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SynaQ5G5D5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SynaQ5G5D5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SynaQ5G5D5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SynaQ5G5D5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SynaQ5G5D5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SynaQ5G5D5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SynaQ5G5D5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SynaQ5G5D5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynaQ5G5D5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SynaQ5G5D5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SynaQ5G5D5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SynaQ5G5D5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynaQ5G5D5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynaQ5G5D5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynaQ5G5D5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynaQ5G5D5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SynaQ5G5D5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynaQ5G5D5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SynaQ5G5D5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SynaQ5G5D5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms