Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Trpm3Q5F4S9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Trpm3Q5F4S9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Trpm3Q5F4S9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Trpm3Q5F4S9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Trpm3Q5F4S9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Trpm3Q5F4S9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Trpm3Q5F4S9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Trpm3Q5F4S9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Trpm3Q5F4S9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Trpm3Q5F4S9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Trpm3Q5F4S9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Trpm3Q5F4S9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Trpm3Q5F4S9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trpm3Q5F4S9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Trpm3Q5F4S9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Trpm3Q5F4S9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trpm3Q5F4S9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Trpm3Q5F4S9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Trpm3Q5F4S9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Trpm3Q5F4S9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Trpm3Q5F4S9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Trpm3Q5F4S9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Trpm3Q5F4S9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Trpm3Q5F4S9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Trpm3Q5F4S9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Trpm3Q5F4S9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Trpm3Q5F4S9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Trpm3Q5F4S9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Trpm3Q5F4S9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Trpm3Q5F4S9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Trpm3Q5F4S9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Trpm3Q5F4S9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Trpm3Q5F4S9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Trpm3Q5F4S9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Trpm3Q5F4S9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Trpm3Q5F4S9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Trpm3Q5F4S9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Trpm3Q5F4S9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Trpm3Q5F4S9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Trpm3Q5F4S9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Trpm3Q5F4S9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trpm3Q5F4S9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Trpm3Q5F4S9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trpm3Q5F4S9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Trpm3Q5F4S9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Trpm3Q5F4S9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trpm3Q5F4S9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Trpm3Q5F4S9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Trpm3Q5F4S9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Trpm3Q5F4S9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Trpm3Q5F4S9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Trpm3Q5F4S9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Trpm3Q5F4S9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Trpm3Q5F4S9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Trpm3Q5F4S9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Trpm3Q5F4S9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Trpm3Q5F4S9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Trpm3Q5F4S9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Trpm3Q5F4S9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Trpm3Q5F4S9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trpm3Q5F4S9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trpm3Q5F4S9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trpm3Q5F4S9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Trpm3Q5F4S9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Trpm3Q5F4S9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Trpm3Q5F4S9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Trpm3Q5F4S9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Trpm3Q5F4S9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Trpm3Q5F4S9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Trpm3Q5F4S9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Trpm3Q5F4S9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Trpm3Q5F4S9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trpm3Q5F4S9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trpm3Q5F4S9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Trpm3Q5F4S9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Trpm3Q5F4S9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Trpm3Q5F4S9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Trpm3Q5F4S9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Trpm3Q5F4S9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Trpm3Q5F4S9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Trpm3Q5F4S9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Trpm3Q5F4S9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Trpm3Q5F4S9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Trpm3Q5F4S9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Trpm3Q5F4S9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Trpm3Q5F4S9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Trpm3Q5F4S9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Trpm3Q5F4S9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Trpm3Q5F4S9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Trpm3Q5F4S9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Trpm3Q5F4S9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Trpm3Q5F4S9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Trpm3Q5F4S9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Trpm3Q5F4S9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trpm3Q5F4S9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trpm3Q5F4S9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trpm3Q5F4S9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trpm3Q5F4S9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Trpm3Q5F4S9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms