Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp22Q5DU02 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp22Q5DU02 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp22Q5DU02 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp22Q5DU02 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp22Q5DU02 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp22Q5DU02 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp22Q5DU02 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp22Q5DU02 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp22Q5DU02 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp22Q5DU02 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp22Q5DU02 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp22Q5DU02 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp22Q5DU02 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp22Q5DU02 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp22Q5DU02 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp22Q5DU02 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp22Q5DU02 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp22Q5DU02 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp22Q5DU02 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp22Q5DU02 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp22Q5DU02 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp22Q5DU02 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp22Q5DU02 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp22Q5DU02 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp22Q5DU02 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp22Q5DU02 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp22Q5DU02 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp22Q5DU02 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp22Q5DU02 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp22Q5DU02 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp22Q5DU02 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp22Q5DU02 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp22Q5DU02 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp22Q5DU02 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp22Q5DU02 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp22Q5DU02 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp22Q5DU02 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp22Q5DU02 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp22Q5DU02 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp22Q5DU02 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp22Q5DU02 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp22Q5DU02 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp22Q5DU02 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp22Q5DU02 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp22Q5DU02 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp22Q5DU02 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp22Q5DU02 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp22Q5DU02 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp22Q5DU02 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp22Q5DU02 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp22Q5DU02 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp22Q5DU02 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp22Q5DU02 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp22Q5DU02 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp22Q5DU02 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp22Q5DU02 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp22Q5DU02 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp22Q5DU02 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp22Q5DU02 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp22Q5DU02 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp22Q5DU02 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp22Q5DU02 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp22Q5DU02 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp22Q5DU02 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp22Q5DU02 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp22Q5DU02 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp22Q5DU02 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp22Q5DU02 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp22Q5DU02 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp22Q5DU02 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp22Q5DU02 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp22Q5DU02 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp22Q5DU02 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp22Q5DU02 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp22Q5DU02 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp22Q5DU02 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp22Q5DU02 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp22Q5DU02 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp22Q5DU02 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp22Q5DU02 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp22Q5DU02 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp22Q5DU02 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp22Q5DU02 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp22Q5DU02 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp22Q5DU02 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp22Q5DU02 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp22Q5DU02 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp22Q5DU02 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp22Q5DU02 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp22Q5DU02 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp22Q5DU02 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp22Q5DU02 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp22Q5DU02 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp22Q5DU02 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp22Q5DU02 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp22Q5DU02 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp22Q5DU02 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp22Q5DU02 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp22Q5DU02 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.3 ms