Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
4930567H17RikQ3V0K5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
4930567H17RikQ3V0K5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
4930567H17RikQ3V0K5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
4930567H17RikQ3V0K5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
4930567H17RikQ3V0K5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
4930567H17RikQ3V0K5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
4930567H17RikQ3V0K5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
4930567H17RikQ3V0K5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
4930567H17RikQ3V0K5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
4930567H17RikQ3V0K5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
4930567H17RikQ3V0K5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
4930567H17RikQ3V0K5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
4930567H17RikQ3V0K5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
4930567H17RikQ3V0K5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
4930567H17RikQ3V0K5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
4930567H17RikQ3V0K5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
4930567H17RikQ3V0K5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
4930567H17RikQ3V0K5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
4930567H17RikQ3V0K5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
4930567H17RikQ3V0K5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
4930567H17RikQ3V0K5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
4930567H17RikQ3V0K5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
4930567H17RikQ3V0K5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
4930567H17RikQ3V0K5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
4930567H17RikQ3V0K5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
4930567H17RikQ3V0K5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
4930567H17RikQ3V0K5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
4930567H17RikQ3V0K5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
4930567H17RikQ3V0K5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
4930567H17RikQ3V0K5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
4930567H17RikQ3V0K5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
4930567H17RikQ3V0K5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
4930567H17RikQ3V0K5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
4930567H17RikQ3V0K5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
4930567H17RikQ3V0K5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
4930567H17RikQ3V0K5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
4930567H17RikQ3V0K5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
4930567H17RikQ3V0K5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
4930567H17RikQ3V0K5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
4930567H17RikQ3V0K5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
4930567H17RikQ3V0K5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
4930567H17RikQ3V0K5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
4930567H17RikQ3V0K5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
4930567H17RikQ3V0K5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
4930567H17RikQ3V0K5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
4930567H17RikQ3V0K5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
4930567H17RikQ3V0K5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
4930567H17RikQ3V0K5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
4930567H17RikQ3V0K5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
4930567H17RikQ3V0K5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
4930567H17RikQ3V0K5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
4930567H17RikQ3V0K5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
4930567H17RikQ3V0K5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
4930567H17RikQ3V0K5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
4930567H17RikQ3V0K5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
4930567H17RikQ3V0K5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
4930567H17RikQ3V0K5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
4930567H17RikQ3V0K5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
4930567H17RikQ3V0K5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
4930567H17RikQ3V0K5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
4930567H17RikQ3V0K5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
4930567H17RikQ3V0K5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
4930567H17RikQ3V0K5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
4930567H17RikQ3V0K5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
4930567H17RikQ3V0K5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
4930567H17RikQ3V0K5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
4930567H17RikQ3V0K5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
4930567H17RikQ3V0K5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
4930567H17RikQ3V0K5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
4930567H17RikQ3V0K5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
4930567H17RikQ3V0K5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
4930567H17RikQ3V0K5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
4930567H17RikQ3V0K5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
4930567H17RikQ3V0K5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
4930567H17RikQ3V0K5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
4930567H17RikQ3V0K5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
4930567H17RikQ3V0K5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
4930567H17RikQ3V0K5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
4930567H17RikQ3V0K5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
4930567H17RikQ3V0K5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
4930567H17RikQ3V0K5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
4930567H17RikQ3V0K5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
4930567H17RikQ3V0K5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
4930567H17RikQ3V0K5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
4930567H17RikQ3V0K5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
4930567H17RikQ3V0K5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
4930567H17RikQ3V0K5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms