Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvipQ3UZP4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvipQ3UZP4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SvipQ3UZP4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SvipQ3UZP4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SvipQ3UZP4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SvipQ3UZP4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SvipQ3UZP4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvipQ3UZP4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvipQ3UZP4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvipQ3UZP4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvipQ3UZP4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvipQ3UZP4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SvipQ3UZP4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SvipQ3UZP4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SvipQ3UZP4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SvipQ3UZP4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SvipQ3UZP4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SvipQ3UZP4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvipQ3UZP4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvipQ3UZP4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvipQ3UZP4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvipQ3UZP4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvipQ3UZP4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvipQ3UZP4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvipQ3UZP4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SvipQ3UZP4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvipQ3UZP4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvipQ3UZP4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvipQ3UZP4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvipQ3UZP4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SvipQ3UZP4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SvipQ3UZP4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SvipQ3UZP4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SvipQ3UZP4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SvipQ3UZP4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SvipQ3UZP4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvipQ3UZP4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvipQ3UZP4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvipQ3UZP4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvipQ3UZP4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvipQ3UZP4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvipQ3UZP4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvipQ3UZP4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SvipQ3UZP4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SvipQ3UZP4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SvipQ3UZP4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SvipQ3UZP4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SvipQ3UZP4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SvipQ3UZP4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SvipQ3UZP4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SvipQ3UZP4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SvipQ3UZP4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SvipQ3UZP4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvipQ3UZP4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvipQ3UZP4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvipQ3UZP4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvipQ3UZP4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvipQ3UZP4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvipQ3UZP4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvipQ3UZP4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvipQ3UZP4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvipQ3UZP4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvipQ3UZP4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvipQ3UZP4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvipQ3UZP4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvipQ3UZP4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvipQ3UZP4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SvipQ3UZP4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvipQ3UZP4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvipQ3UZP4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvipQ3UZP4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvipQ3UZP4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvipQ3UZP4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvipQ3UZP4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SvipQ3UZP4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SvipQ3UZP4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SvipQ3UZP4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SvipQ3UZP4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SvipQ3UZP4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvipQ3UZP4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvipQ3UZP4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvipQ3UZP4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SvipQ3UZP4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvipQ3UZP4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvipQ3UZP4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SvipQ3UZP4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvipQ3UZP4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SvipQ3UZP4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvipQ3UZP4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvipQ3UZP4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvipQ3UZP4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvipQ3UZP4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvipQ3UZP4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvipQ3UZP4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvipQ3UZP4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvipQ3UZP4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvipQ3UZP4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvipQ3UZP4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvipQ3UZP4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms