Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrc55Q3UY51 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lrrc55Q3UY51 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrrc55Q3UY51 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrrc55Q3UY51 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrrc55Q3UY51 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrrc55Q3UY51 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lrrc55Q3UY51 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lrrc55Q3UY51 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc55Q3UY51 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc55Q3UY51 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc55Q3UY51 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc55Q3UY51 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc55Q3UY51 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc55Q3UY51 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc55Q3UY51 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lrrc55Q3UY51 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrrc55Q3UY51 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrc55Q3UY51 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrc55Q3UY51 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrc55Q3UY51 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc55Q3UY51 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc55Q3UY51 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc55Q3UY51 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrrc55Q3UY51 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lrrc55Q3UY51 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrrc55Q3UY51 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrrc55Q3UY51 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc55Q3UY51 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc55Q3UY51 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrrc55Q3UY51 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrrc55Q3UY51 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrrc55Q3UY51 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrrc55Q3UY51 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrrc55Q3UY51 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc55Q3UY51 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrrc55Q3UY51 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrrc55Q3UY51 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrc55Q3UY51 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrrc55Q3UY51 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrrc55Q3UY51 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrc55Q3UY51 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrc55Q3UY51 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrc55Q3UY51 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrrc55Q3UY51 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lrrc55Q3UY51 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Lrrc55Q3UY51 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrc55Q3UY51 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc55Q3UY51 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrc55Q3UY51 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrc55Q3UY51 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrc55Q3UY51 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrc55Q3UY51 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrrc55Q3UY51 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrrc55Q3UY51 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrc55Q3UY51 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrc55Q3UY51 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrrc55Q3UY51 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrc55Q3UY51 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrrc55Q3UY51 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc55Q3UY51 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrc55Q3UY51 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrc55Q3UY51 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc55Q3UY51 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc55Q3UY51 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrrc55Q3UY51 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc55Q3UY51 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc55Q3UY51 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc55Q3UY51 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Lrrc55Q3UY51 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrrc55Q3UY51 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrrc55Q3UY51 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrrc55Q3UY51 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc55Q3UY51 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrrc55Q3UY51 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrrc55Q3UY51 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrrc55Q3UY51 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrrc55Q3UY51 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms