Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clca4bQ3UW98 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Clca4bQ3UW98 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Clca4bQ3UW98 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clca4bQ3UW98 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clca4bQ3UW98 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clca4bQ3UW98 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clca4bQ3UW98 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clca4bQ3UW98 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clca4bQ3UW98 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clca4bQ3UW98 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clca4bQ3UW98 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Clca4bQ3UW98 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clca4bQ3UW98 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clca4bQ3UW98 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clca4bQ3UW98 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clca4bQ3UW98 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clca4bQ3UW98 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clca4bQ3UW98 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clca4bQ3UW98 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clca4bQ3UW98 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Clca4bQ3UW98 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clca4bQ3UW98 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clca4bQ3UW98 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clca4bQ3UW98 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clca4bQ3UW98 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Clca4bQ3UW98 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clca4bQ3UW98 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clca4bQ3UW98 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clca4bQ3UW98 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clca4bQ3UW98 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clca4bQ3UW98 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clca4bQ3UW98 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clca4bQ3UW98 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca4bQ3UW98 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca4bQ3UW98 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca4bQ3UW98 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clca4bQ3UW98 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clca4bQ3UW98 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca4bQ3UW98 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Clca4bQ3UW98 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clca4bQ3UW98 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clca4bQ3UW98 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clca4bQ3UW98 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clca4bQ3UW98 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clca4bQ3UW98 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clca4bQ3UW98 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca4bQ3UW98 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca4bQ3UW98 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca4bQ3UW98 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clca4bQ3UW98 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clca4bQ3UW98 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca4bQ3UW98 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clca4bQ3UW98 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Clca4bQ3UW98 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca4bQ3UW98 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca4bQ3UW98 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca4bQ3UW98 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clca4bQ3UW98 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clca4bQ3UW98 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clca4bQ3UW98 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clca4bQ3UW98 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clca4bQ3UW98 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Clca4bQ3UW98 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clca4bQ3UW98 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clca4bQ3UW98 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clca4bQ3UW98 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clca4bQ3UW98 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clca4bQ3UW98 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clca4bQ3UW98 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clca4bQ3UW98 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clca4bQ3UW98 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clca4bQ3UW98 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clca4bQ3UW98 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clca4bQ3UW98 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clca4bQ3UW98 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clca4bQ3UW98 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clca4bQ3UW98 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clca4bQ3UW98 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clca4bQ3UW98 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clca4bQ3UW98 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clca4bQ3UW98 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clca4bQ3UW98 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clca4bQ3UW98 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clca4bQ3UW98 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clca4bQ3UW98 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clca4bQ3UW98 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clca4bQ3UW98 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Clca4bQ3UW98 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clca4bQ3UW98 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clca4bQ3UW98 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clca4bQ3UW98 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clca4bQ3UW98 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clca4bQ3UW98 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clca4bQ3UW98 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clca4bQ3UW98 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca4bQ3UW98 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca4bQ3UW98 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca4bQ3UW98 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca4bQ3UW98 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms