Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
D130052B06RikQ3UW13 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
D130052B06RikQ3UW13 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
D130052B06RikQ3UW13 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
D130052B06RikQ3UW13 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
D130052B06RikQ3UW13 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
D130052B06RikQ3UW13 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
D130052B06RikQ3UW13 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
D130052B06RikQ3UW13 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
D130052B06RikQ3UW13 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
D130052B06RikQ3UW13 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
D130052B06RikQ3UW13 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
D130052B06RikQ3UW13 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
D130052B06RikQ3UW13 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
D130052B06RikQ3UW13 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
D130052B06RikQ3UW13 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
D130052B06RikQ3UW13 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
D130052B06RikQ3UW13 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
D130052B06RikQ3UW13 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
D130052B06RikQ3UW13 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D130052B06RikQ3UW13 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D130052B06RikQ3UW13 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D130052B06RikQ3UW13 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
D130052B06RikQ3UW13 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
D130052B06RikQ3UW13 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D130052B06RikQ3UW13 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D130052B06RikQ3UW13 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D130052B06RikQ3UW13 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D130052B06RikQ3UW13 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
D130052B06RikQ3UW13 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
D130052B06RikQ3UW13 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D130052B06RikQ3UW13 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
D130052B06RikQ3UW13 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
D130052B06RikQ3UW13 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
D130052B06RikQ3UW13 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
D130052B06RikQ3UW13 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
D130052B06RikQ3UW13 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
D130052B06RikQ3UW13 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
D130052B06RikQ3UW13 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
D130052B06RikQ3UW13 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
D130052B06RikQ3UW13 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
D130052B06RikQ3UW13 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D130052B06RikQ3UW13 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
D130052B06RikQ3UW13 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
D130052B06RikQ3UW13 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D130052B06RikQ3UW13 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
D130052B06RikQ3UW13 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
D130052B06RikQ3UW13 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
D130052B06RikQ3UW13 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D130052B06RikQ3UW13 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D130052B06RikQ3UW13 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D130052B06RikQ3UW13 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D130052B06RikQ3UW13 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D130052B06RikQ3UW13 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
D130052B06RikQ3UW13 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D130052B06RikQ3UW13 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D130052B06RikQ3UW13 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D130052B06RikQ3UW13 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
D130052B06RikQ3UW13 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D130052B06RikQ3UW13 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
D130052B06RikQ3UW13 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
D130052B06RikQ3UW13 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
D130052B06RikQ3UW13 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D130052B06RikQ3UW13 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
D130052B06RikQ3UW13 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
D130052B06RikQ3UW13 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
D130052B06RikQ3UW13 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D130052B06RikQ3UW13 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
D130052B06RikQ3UW13 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
D130052B06RikQ3UW13 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
D130052B06RikQ3UW13 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
D130052B06RikQ3UW13 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
D130052B06RikQ3UW13 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
D130052B06RikQ3UW13 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
D130052B06RikQ3UW13 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
D130052B06RikQ3UW13 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
D130052B06RikQ3UW13 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
D130052B06RikQ3UW13 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
D130052B06RikQ3UW13 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
D130052B06RikQ3UW13 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
D130052B06RikQ3UW13 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D130052B06RikQ3UW13 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D130052B06RikQ3UW13 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
D130052B06RikQ3UW13 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
D130052B06RikQ3UW13 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D130052B06RikQ3UW13 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D130052B06RikQ3UW13 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D130052B06RikQ3UW13 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D130052B06RikQ3UW13 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D130052B06RikQ3UW13 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D130052B06RikQ3UW13 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D130052B06RikQ3UW13 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D130052B06RikQ3UW13 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
D130052B06RikQ3UW13 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
D130052B06RikQ3UW13 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
D130052B06RikQ3UW13 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
D130052B06RikQ3UW13 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
D130052B06RikQ3UW13 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms