Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B3gnt6Q3USF0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B3gnt6Q3USF0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B3gnt6Q3USF0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B3gnt6Q3USF0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B3gnt6Q3USF0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B3gnt6Q3USF0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B3gnt6Q3USF0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B3gnt6Q3USF0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B3gnt6Q3USF0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B3gnt6Q3USF0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B3gnt6Q3USF0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B3gnt6Q3USF0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
B3gnt6Q3USF0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B3gnt6Q3USF0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B3gnt6Q3USF0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B3gnt6Q3USF0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B3gnt6Q3USF0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B3gnt6Q3USF0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
B3gnt6Q3USF0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
B3gnt6Q3USF0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
B3gnt6Q3USF0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B3gnt6Q3USF0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B3gnt6Q3USF0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3gnt6Q3USF0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3gnt6Q3USF0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3gnt6Q3USF0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B3gnt6Q3USF0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B3gnt6Q3USF0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
B3gnt6Q3USF0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B3gnt6Q3USF0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B3gnt6Q3USF0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B3gnt6Q3USF0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B3gnt6Q3USF0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B3gnt6Q3USF0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B3gnt6Q3USF0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3gnt6Q3USF0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3gnt6Q3USF0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B3gnt6Q3USF0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
B3gnt6Q3USF0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
B3gnt6Q3USF0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B3gnt6Q3USF0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B3gnt6Q3USF0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B3gnt6Q3USF0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
B3gnt6Q3USF0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B3gnt6Q3USF0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B3gnt6Q3USF0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B3gnt6Q3USF0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
B3gnt6Q3USF0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B3gnt6Q3USF0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B3gnt6Q3USF0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B3gnt6Q3USF0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
B3gnt6Q3USF0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B3gnt6Q3USF0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B3gnt6Q3USF0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B3gnt6Q3USF0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B3gnt6Q3USF0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B3gnt6Q3USF0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3gnt6Q3USF0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3gnt6Q3USF0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3gnt6Q3USF0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3gnt6Q3USF0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3gnt6Q3USF0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B3gnt6Q3USF0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
B3gnt6Q3USF0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B3gnt6Q3USF0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B3gnt6Q3USF0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
B3gnt6Q3USF0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
B3gnt6Q3USF0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B3gnt6Q3USF0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
B3gnt6Q3USF0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B3gnt6Q3USF0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B3gnt6Q3USF0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B3gnt6Q3USF0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B3gnt6Q3USF0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B3gnt6Q3USF0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B3gnt6Q3USF0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B3gnt6Q3USF0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
B3gnt6Q3USF0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
B3gnt6Q3USF0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
B3gnt6Q3USF0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
B3gnt6Q3USF0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B3gnt6Q3USF0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B3gnt6Q3USF0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B3gnt6Q3USF0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B3gnt6Q3USF0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3gnt6Q3USF0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3gnt6Q3USF0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3gnt6Q3USF0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3gnt6Q3USF0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3gnt6Q3USF0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B3gnt6Q3USF0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B3gnt6Q3USF0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B3gnt6Q3USF0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
B3gnt6Q3USF0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
B3gnt6Q3USF0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B3gnt6Q3USF0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B3gnt6Q3USF0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3gnt6Q3USF0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3gnt6Q3USF0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms