Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zscan4fQ3URS2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zscan4fQ3URS2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zscan4fQ3URS2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zscan4fQ3URS2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zscan4fQ3URS2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Zscan4fQ3URS2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zscan4fQ3URS2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zscan4fQ3URS2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zscan4fQ3URS2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zscan4fQ3URS2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zscan4fQ3URS2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zscan4fQ3URS2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zscan4fQ3URS2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zscan4fQ3URS2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zscan4fQ3URS2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zscan4fQ3URS2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zscan4fQ3URS2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Zscan4fQ3URS2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zscan4fQ3URS2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zscan4fQ3URS2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zscan4fQ3URS2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zscan4fQ3URS2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zscan4fQ3URS2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zscan4fQ3URS2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zscan4fQ3URS2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zscan4fQ3URS2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zscan4fQ3URS2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zscan4fQ3URS2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zscan4fQ3URS2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zscan4fQ3URS2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zscan4fQ3URS2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Zscan4fQ3URS2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zscan4fQ3URS2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Zscan4fQ3URS2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zscan4fQ3URS2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zscan4fQ3URS2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zscan4fQ3URS2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zscan4fQ3URS2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zscan4fQ3URS2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zscan4fQ3URS2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zscan4fQ3URS2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zscan4fQ3URS2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zscan4fQ3URS2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zscan4fQ3URS2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zscan4fQ3URS2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zscan4fQ3URS2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zscan4fQ3URS2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zscan4fQ3URS2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zscan4fQ3URS2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Zscan4fQ3URS2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zscan4fQ3URS2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zscan4fQ3URS2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Zscan4fQ3URS2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zscan4fQ3URS2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zscan4fQ3URS2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zscan4fQ3URS2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Zscan4fQ3URS2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zscan4fQ3URS2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Zscan4fQ3URS2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zscan4fQ3URS2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zscan4fQ3URS2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zscan4fQ3URS2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zscan4fQ3URS2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zscan4fQ3URS2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zscan4fQ3URS2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zscan4fQ3URS2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zscan4fQ3URS2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zscan4fQ3URS2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zscan4fQ3URS2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zscan4fQ3URS2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zscan4fQ3URS2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zscan4fQ3URS2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zscan4fQ3URS2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zscan4fQ3URS2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zscan4fQ3URS2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zscan4fQ3URS2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Zscan4fQ3URS2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zscan4fQ3URS2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zscan4fQ3URS2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Zscan4fQ3URS2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zscan4fQ3URS2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zscan4fQ3URS2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zscan4fQ3URS2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zscan4fQ3URS2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zscan4fQ3URS2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zscan4fQ3URS2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Zscan4fQ3URS2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zscan4fQ3URS2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zscan4fQ3URS2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zscan4fQ3URS2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zscan4fQ3URS2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zscan4fQ3URS2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zscan4fQ3URS2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zscan4fQ3URS2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zscan4fQ3URS2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zscan4fQ3URS2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zscan4fQ3URS2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zscan4fQ3URS2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zscan4fQ3URS2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms