Protein–RNA interactions for Protein: Q3URD2

Rprml, Reprimo-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmlQ3URD2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RprmlQ3URD2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RprmlQ3URD2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RprmlQ3URD2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RprmlQ3URD2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RprmlQ3URD2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RprmlQ3URD2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RprmlQ3URD2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RprmlQ3URD2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RprmlQ3URD2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RprmlQ3URD2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RprmlQ3URD2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RprmlQ3URD2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RprmlQ3URD2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RprmlQ3URD2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RprmlQ3URD2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RprmlQ3URD2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RprmlQ3URD2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RprmlQ3URD2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RprmlQ3URD2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RprmlQ3URD2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RprmlQ3URD2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RprmlQ3URD2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RprmlQ3URD2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RprmlQ3URD2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RprmlQ3URD2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RprmlQ3URD2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RprmlQ3URD2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RprmlQ3URD2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RprmlQ3URD2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RprmlQ3URD2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RprmlQ3URD2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RprmlQ3URD2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RprmlQ3URD2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RprmlQ3URD2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RprmlQ3URD2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RprmlQ3URD2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RprmlQ3URD2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RprmlQ3URD2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RprmlQ3URD2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RprmlQ3URD2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RprmlQ3URD2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RprmlQ3URD2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RprmlQ3URD2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RprmlQ3URD2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RprmlQ3URD2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RprmlQ3URD2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RprmlQ3URD2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RprmlQ3URD2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RprmlQ3URD2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RprmlQ3URD2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RprmlQ3URD2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RprmlQ3URD2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RprmlQ3URD2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RprmlQ3URD2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RprmlQ3URD2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RprmlQ3URD2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RprmlQ3URD2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RprmlQ3URD2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RprmlQ3URD2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RprmlQ3URD2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RprmlQ3URD2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RprmlQ3URD2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RprmlQ3URD2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RprmlQ3URD2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RprmlQ3URD2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RprmlQ3URD2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RprmlQ3URD2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RprmlQ3URD2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RprmlQ3URD2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RprmlQ3URD2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RprmlQ3URD2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RprmlQ3URD2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RprmlQ3URD2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RprmlQ3URD2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RprmlQ3URD2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RprmlQ3URD2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RprmlQ3URD2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RprmlQ3URD2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RprmlQ3URD2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms