Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mccc2Q3ULD5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mccc2Q3ULD5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mccc2Q3ULD5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mccc2Q3ULD5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mccc2Q3ULD5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mccc2Q3ULD5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mccc2Q3ULD5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mccc2Q3ULD5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mccc2Q3ULD5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mccc2Q3ULD5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mccc2Q3ULD5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mccc2Q3ULD5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mccc2Q3ULD5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mccc2Q3ULD5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mccc2Q3ULD5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mccc2Q3ULD5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mccc2Q3ULD5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mccc2Q3ULD5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mccc2Q3ULD5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mccc2Q3ULD5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mccc2Q3ULD5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mccc2Q3ULD5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mccc2Q3ULD5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mccc2Q3ULD5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mccc2Q3ULD5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mccc2Q3ULD5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mccc2Q3ULD5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mccc2Q3ULD5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mccc2Q3ULD5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mccc2Q3ULD5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mccc2Q3ULD5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mccc2Q3ULD5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mccc2Q3ULD5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mccc2Q3ULD5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mccc2Q3ULD5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mccc2Q3ULD5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mccc2Q3ULD5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mccc2Q3ULD5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mccc2Q3ULD5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mccc2Q3ULD5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mccc2Q3ULD5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mccc2Q3ULD5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mccc2Q3ULD5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mccc2Q3ULD5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mccc2Q3ULD5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mccc2Q3ULD5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mccc2Q3ULD5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mccc2Q3ULD5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mccc2Q3ULD5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mccc2Q3ULD5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mccc2Q3ULD5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mccc2Q3ULD5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mccc2Q3ULD5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mccc2Q3ULD5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mccc2Q3ULD5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mccc2Q3ULD5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mccc2Q3ULD5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mccc2Q3ULD5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mccc2Q3ULD5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mccc2Q3ULD5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mccc2Q3ULD5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mccc2Q3ULD5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mccc2Q3ULD5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mccc2Q3ULD5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mccc2Q3ULD5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mccc2Q3ULD5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mccc2Q3ULD5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mccc2Q3ULD5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mccc2Q3ULD5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mccc2Q3ULD5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mccc2Q3ULD5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mccc2Q3ULD5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mccc2Q3ULD5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mccc2Q3ULD5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mccc2Q3ULD5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mccc2Q3ULD5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mccc2Q3ULD5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mccc2Q3ULD5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mccc2Q3ULD5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mccc2Q3ULD5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mccc2Q3ULD5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mccc2Q3ULD5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mccc2Q3ULD5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mccc2Q3ULD5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mccc2Q3ULD5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mccc2Q3ULD5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mccc2Q3ULD5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mccc2Q3ULD5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mccc2Q3ULD5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mccc2Q3ULD5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mccc2Q3ULD5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mccc2Q3ULD5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mccc2Q3ULD5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mccc2Q3ULD5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mccc2Q3ULD5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mccc2Q3ULD5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mccc2Q3ULD5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mccc2Q3ULD5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mccc2Q3ULD5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms