Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf166Q3U9F6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf166Q3U9F6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf166Q3U9F6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf166Q3U9F6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf166Q3U9F6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf166Q3U9F6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf166Q3U9F6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf166Q3U9F6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf166Q3U9F6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf166Q3U9F6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf166Q3U9F6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf166Q3U9F6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf166Q3U9F6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf166Q3U9F6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf166Q3U9F6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf166Q3U9F6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf166Q3U9F6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf166Q3U9F6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf166Q3U9F6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf166Q3U9F6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf166Q3U9F6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf166Q3U9F6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf166Q3U9F6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf166Q3U9F6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf166Q3U9F6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf166Q3U9F6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf166Q3U9F6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf166Q3U9F6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf166Q3U9F6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf166Q3U9F6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf166Q3U9F6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf166Q3U9F6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf166Q3U9F6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf166Q3U9F6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf166Q3U9F6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf166Q3U9F6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf166Q3U9F6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf166Q3U9F6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf166Q3U9F6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf166Q3U9F6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf166Q3U9F6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf166Q3U9F6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf166Q3U9F6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf166Q3U9F6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf166Q3U9F6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf166Q3U9F6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf166Q3U9F6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf166Q3U9F6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf166Q3U9F6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf166Q3U9F6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf166Q3U9F6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf166Q3U9F6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf166Q3U9F6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf166Q3U9F6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf166Q3U9F6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf166Q3U9F6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf166Q3U9F6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf166Q3U9F6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf166Q3U9F6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf166Q3U9F6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf166Q3U9F6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf166Q3U9F6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf166Q3U9F6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf166Q3U9F6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf166Q3U9F6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf166Q3U9F6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf166Q3U9F6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf166Q3U9F6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf166Q3U9F6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf166Q3U9F6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf166Q3U9F6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf166Q3U9F6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf166Q3U9F6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf166Q3U9F6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf166Q3U9F6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf166Q3U9F6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf166Q3U9F6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf166Q3U9F6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf166Q3U9F6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf166Q3U9F6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf166Q3U9F6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf166Q3U9F6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf166Q3U9F6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf166Q3U9F6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf166Q3U9F6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf166Q3U9F6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf166Q3U9F6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf166Q3U9F6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf166Q3U9F6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf166Q3U9F6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf166Q3U9F6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf166Q3U9F6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf166Q3U9F6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf166Q3U9F6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf166Q3U9F6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf166Q3U9F6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf166Q3U9F6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf166Q3U9F6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf166Q3U9F6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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