Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tatdn3Q3U1C6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tatdn3Q3U1C6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Tatdn3Q3U1C6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tatdn3Q3U1C6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tatdn3Q3U1C6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tatdn3Q3U1C6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tatdn3Q3U1C6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tatdn3Q3U1C6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tatdn3Q3U1C6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tatdn3Q3U1C6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tatdn3Q3U1C6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tatdn3Q3U1C6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tatdn3Q3U1C6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tatdn3Q3U1C6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tatdn3Q3U1C6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tatdn3Q3U1C6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tatdn3Q3U1C6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Tatdn3Q3U1C6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tatdn3Q3U1C6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tatdn3Q3U1C6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tatdn3Q3U1C6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tatdn3Q3U1C6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tatdn3Q3U1C6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tatdn3Q3U1C6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tatdn3Q3U1C6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tatdn3Q3U1C6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tatdn3Q3U1C6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tatdn3Q3U1C6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Tatdn3Q3U1C6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tatdn3Q3U1C6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tatdn3Q3U1C6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tatdn3Q3U1C6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tatdn3Q3U1C6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tatdn3Q3U1C6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tatdn3Q3U1C6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tatdn3Q3U1C6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tatdn3Q3U1C6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tatdn3Q3U1C6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Tatdn3Q3U1C6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tatdn3Q3U1C6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tatdn3Q3U1C6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tatdn3Q3U1C6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tatdn3Q3U1C6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tatdn3Q3U1C6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tatdn3Q3U1C6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tatdn3Q3U1C6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tatdn3Q3U1C6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tatdn3Q3U1C6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tatdn3Q3U1C6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Tatdn3Q3U1C6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tatdn3Q3U1C6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tatdn3Q3U1C6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tatdn3Q3U1C6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tatdn3Q3U1C6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tatdn3Q3U1C6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tatdn3Q3U1C6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tatdn3Q3U1C6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tatdn3Q3U1C6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Tatdn3Q3U1C6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tatdn3Q3U1C6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tatdn3Q3U1C6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tatdn3Q3U1C6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tatdn3Q3U1C6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tatdn3Q3U1C6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tatdn3Q3U1C6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tatdn3Q3U1C6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tatdn3Q3U1C6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tatdn3Q3U1C6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tatdn3Q3U1C6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tatdn3Q3U1C6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tatdn3Q3U1C6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Tatdn3Q3U1C6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tatdn3Q3U1C6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tatdn3Q3U1C6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tatdn3Q3U1C6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tatdn3Q3U1C6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tatdn3Q3U1C6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tatdn3Q3U1C6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tatdn3Q3U1C6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tatdn3Q3U1C6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tatdn3Q3U1C6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tatdn3Q3U1C6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tatdn3Q3U1C6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tatdn3Q3U1C6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tatdn3Q3U1C6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tatdn3Q3U1C6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tatdn3Q3U1C6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tatdn3Q3U1C6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tatdn3Q3U1C6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tatdn3Q3U1C6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tatdn3Q3U1C6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tatdn3Q3U1C6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tatdn3Q3U1C6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tatdn3Q3U1C6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tatdn3Q3U1C6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tatdn3Q3U1C6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tatdn3Q3U1C6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tatdn3Q3U1C6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms