Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZI6

Ccnj, Cyclin-J, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjQ3TZI6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnjQ3TZI6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnjQ3TZI6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnjQ3TZI6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CcnjQ3TZI6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CcnjQ3TZI6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcnjQ3TZI6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnjQ3TZI6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnjQ3TZI6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnjQ3TZI6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnjQ3TZI6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnjQ3TZI6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnjQ3TZI6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnjQ3TZI6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnjQ3TZI6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnjQ3TZI6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnjQ3TZI6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CcnjQ3TZI6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcnjQ3TZI6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcnjQ3TZI6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CcnjQ3TZI6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CcnjQ3TZI6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcnjQ3TZI6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcnjQ3TZI6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcnjQ3TZI6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcnjQ3TZI6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcnjQ3TZI6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcnjQ3TZI6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcnjQ3TZI6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcnjQ3TZI6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcnjQ3TZI6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CcnjQ3TZI6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcnjQ3TZI6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcnjQ3TZI6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcnjQ3TZI6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcnjQ3TZI6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcnjQ3TZI6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CcnjQ3TZI6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcnjQ3TZI6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcnjQ3TZI6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcnjQ3TZI6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcnjQ3TZI6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcnjQ3TZI6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnjQ3TZI6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnjQ3TZI6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnjQ3TZI6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcnjQ3TZI6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcnjQ3TZI6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcnjQ3TZI6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcnjQ3TZI6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CcnjQ3TZI6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcnjQ3TZI6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcnjQ3TZI6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcnjQ3TZI6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcnjQ3TZI6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcnjQ3TZI6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcnjQ3TZI6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CcnjQ3TZI6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CcnjQ3TZI6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CcnjQ3TZI6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CcnjQ3TZI6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnjQ3TZI6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnjQ3TZI6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnjQ3TZI6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnjQ3TZI6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcnjQ3TZI6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcnjQ3TZI6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcnjQ3TZI6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcnjQ3TZI6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcnjQ3TZI6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcnjQ3TZI6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcnjQ3TZI6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcnjQ3TZI6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcnjQ3TZI6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnjQ3TZI6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcnjQ3TZI6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcnjQ3TZI6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcnjQ3TZI6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcnjQ3TZI6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcnjQ3TZI6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcnjQ3TZI6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcnjQ3TZI6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcnjQ3TZI6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CcnjQ3TZI6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcnjQ3TZI6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcnjQ3TZI6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcnjQ3TZI6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcnjQ3TZI6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcnjQ3TZI6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcnjQ3TZI6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CcnjQ3TZI6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcnjQ3TZI6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcnjQ3TZI6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CcnjQ3TZI6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CcnjQ3TZI6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CcnjQ3TZI6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CcnjQ3TZI6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcnjQ3TZI6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcnjQ3TZI6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcnjQ3TZI6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms