Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Srsf6Q3TWW8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Srsf6Q3TWW8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srsf6Q3TWW8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srsf6Q3TWW8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srsf6Q3TWW8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srsf6Q3TWW8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srsf6Q3TWW8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srsf6Q3TWW8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srsf6Q3TWW8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srsf6Q3TWW8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srsf6Q3TWW8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srsf6Q3TWW8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srsf6Q3TWW8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srsf6Q3TWW8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srsf6Q3TWW8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srsf6Q3TWW8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Srsf6Q3TWW8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srsf6Q3TWW8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srsf6Q3TWW8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srsf6Q3TWW8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srsf6Q3TWW8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Srsf6Q3TWW8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srsf6Q3TWW8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Srsf6Q3TWW8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srsf6Q3TWW8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srsf6Q3TWW8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Srsf6Q3TWW8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srsf6Q3TWW8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srsf6Q3TWW8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srsf6Q3TWW8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srsf6Q3TWW8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srsf6Q3TWW8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srsf6Q3TWW8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srsf6Q3TWW8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Srsf6Q3TWW8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srsf6Q3TWW8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srsf6Q3TWW8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srsf6Q3TWW8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srsf6Q3TWW8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srsf6Q3TWW8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srsf6Q3TWW8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srsf6Q3TWW8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srsf6Q3TWW8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srsf6Q3TWW8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srsf6Q3TWW8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srsf6Q3TWW8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srsf6Q3TWW8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srsf6Q3TWW8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Srsf6Q3TWW8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srsf6Q3TWW8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srsf6Q3TWW8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srsf6Q3TWW8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srsf6Q3TWW8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Srsf6Q3TWW8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srsf6Q3TWW8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srsf6Q3TWW8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srsf6Q3TWW8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srsf6Q3TWW8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srsf6Q3TWW8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srsf6Q3TWW8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srsf6Q3TWW8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srsf6Q3TWW8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srsf6Q3TWW8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srsf6Q3TWW8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srsf6Q3TWW8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Srsf6Q3TWW8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srsf6Q3TWW8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srsf6Q3TWW8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Srsf6Q3TWW8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Srsf6Q3TWW8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Srsf6Q3TWW8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Srsf6Q3TWW8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Srsf6Q3TWW8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Srsf6Q3TWW8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srsf6Q3TWW8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srsf6Q3TWW8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Srsf6Q3TWW8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srsf6Q3TWW8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Srsf6Q3TWW8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srsf6Q3TWW8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srsf6Q3TWW8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Srsf6Q3TWW8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Srsf6Q3TWW8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srsf6Q3TWW8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srsf6Q3TWW8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srsf6Q3TWW8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srsf6Q3TWW8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Srsf6Q3TWW8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srsf6Q3TWW8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srsf6Q3TWW8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Srsf6Q3TWW8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srsf6Q3TWW8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srsf6Q3TWW8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srsf6Q3TWW8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Srsf6Q3TWW8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srsf6Q3TWW8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srsf6Q3TWW8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srsf6Q3TWW8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms