Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdgfl1Q2VPR5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdgfl1Q2VPR5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdgfl1Q2VPR5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Hdgfl1Q2VPR5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Hdgfl1Q2VPR5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hdgfl1Q2VPR5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdgfl1Q2VPR5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Hdgfl1Q2VPR5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hdgfl1Q2VPR5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Hdgfl1Q2VPR5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Hdgfl1Q2VPR5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hdgfl1Q2VPR5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Hdgfl1Q2VPR5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdgfl1Q2VPR5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdgfl1Q2VPR5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdgfl1Q2VPR5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdgfl1Q2VPR5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hdgfl1Q2VPR5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdgfl1Q2VPR5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdgfl1Q2VPR5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdgfl1Q2VPR5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdgfl1Q2VPR5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdgfl1Q2VPR5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdgfl1Q2VPR5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdgfl1Q2VPR5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdgfl1Q2VPR5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdgfl1Q2VPR5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdgfl1Q2VPR5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hdgfl1Q2VPR5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Hdgfl1Q2VPR5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hdgfl1Q2VPR5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hdgfl1Q2VPR5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hdgfl1Q2VPR5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdgfl1Q2VPR5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdgfl1Q2VPR5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdgfl1Q2VPR5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdgfl1Q2VPR5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdgfl1Q2VPR5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hdgfl1Q2VPR5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hdgfl1Q2VPR5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdgfl1Q2VPR5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdgfl1Q2VPR5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdgfl1Q2VPR5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hdgfl1Q2VPR5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hdgfl1Q2VPR5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdgfl1Q2VPR5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hdgfl1Q2VPR5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hdgfl1Q2VPR5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdgfl1Q2VPR5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hdgfl1Q2VPR5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdgfl1Q2VPR5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hdgfl1Q2VPR5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hdgfl1Q2VPR5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdgfl1Q2VPR5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdgfl1Q2VPR5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdgfl1Q2VPR5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdgfl1Q2VPR5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdgfl1Q2VPR5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdgfl1Q2VPR5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdgfl1Q2VPR5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdgfl1Q2VPR5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdgfl1Q2VPR5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdgfl1Q2VPR5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hdgfl1Q2VPR5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdgfl1Q2VPR5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdgfl1Q2VPR5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdgfl1Q2VPR5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdgfl1Q2VPR5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdgfl1Q2VPR5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdgfl1Q2VPR5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdgfl1Q2VPR5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdgfl1Q2VPR5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdgfl1Q2VPR5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdgfl1Q2VPR5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Hdgfl1Q2VPR5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdgfl1Q2VPR5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdgfl1Q2VPR5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdgfl1Q2VPR5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdgfl1Q2VPR5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms