Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Tdrd9Q14BI7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Tdrd9Q14BI7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Tdrd9Q14BI7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Tdrd9Q14BI7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC40.38■■■■■ 4.06
Tdrd9Q14BI7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Tdrd9Q14BI7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Tdrd9Q14BI7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Tdrd9Q14BI7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Tdrd9Q14BI7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
Tdrd9Q14BI7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Tdrd9Q14BI7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Tdrd9Q14BI7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Tdrd9Q14BI7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Tdrd9Q14BI7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Tdrd9Q14BI7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Tdrd9Q14BI7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Tdrd9Q14BI7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Tdrd9Q14BI7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Tdrd9Q14BI7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
Tdrd9Q14BI7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Tdrd9Q14BI7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Tdrd9Q14BI7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Tdrd9Q14BI7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Tdrd9Q14BI7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Tdrd9Q14BI7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Tdrd9Q14BI7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Tdrd9Q14BI7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Tdrd9Q14BI7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Tdrd9Q14BI7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Tdrd9Q14BI7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Tdrd9Q14BI7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
Tdrd9Q14BI7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Tdrd9Q14BI7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Tdrd9Q14BI7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Tdrd9Q14BI7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Tdrd9Q14BI7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Tdrd9Q14BI7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Tdrd9Q14BI7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Tdrd9Q14BI7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Tdrd9Q14BI7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Tdrd9Q14BI7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Tdrd9Q14BI7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Tdrd9Q14BI7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Tdrd9Q14BI7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Tdrd9Q14BI7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Tdrd9Q14BI7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Tdrd9Q14BI7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Tdrd9Q14BI7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Tdrd9Q14BI7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Tdrd9Q14BI7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Tdrd9Q14BI7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Tdrd9Q14BI7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Tdrd9Q14BI7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Tdrd9Q14BI7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Tdrd9Q14BI7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Tdrd9Q14BI7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Tdrd9Q14BI7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Tdrd9Q14BI7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Tdrd9Q14BI7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Tdrd9Q14BI7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Tdrd9Q14BI7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Tdrd9Q14BI7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Tdrd9Q14BI7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Tdrd9Q14BI7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Tdrd9Q14BI7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Tdrd9Q14BI7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Tdrd9Q14BI7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Tdrd9Q14BI7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Tdrd9Q14BI7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Tdrd9Q14BI7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Tdrd9Q14BI7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Tdrd9Q14BI7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
Tdrd9Q14BI7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Tdrd9Q14BI7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Tdrd9Q14BI7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Tdrd9Q14BI7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
Tdrd9Q14BI7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Tdrd9Q14BI7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Tdrd9Q14BI7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Tdrd9Q14BI7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Tdrd9Q14BI7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Tdrd9Q14BI7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Tdrd9Q14BI7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Tdrd9Q14BI7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Tdrd9Q14BI7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
Tdrd9Q14BI7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Tdrd9Q14BI7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Tdrd9Q14BI7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Tdrd9Q14BI7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Tdrd9Q14BI7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Tdrd9Q14BI7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Tdrd9Q14BI7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Tdrd9Q14BI7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Tdrd9Q14BI7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Tdrd9Q14BI7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Tdrd9Q14BI7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Tdrd9Q14BI7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Tdrd9Q14BI7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Tdrd9Q14BI7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms