Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NeblQ0II04 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NeblQ0II04 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NeblQ0II04 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NeblQ0II04 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NeblQ0II04 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NeblQ0II04 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NeblQ0II04 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NeblQ0II04 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NeblQ0II04 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NeblQ0II04 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NeblQ0II04 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NeblQ0II04 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NeblQ0II04 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NeblQ0II04 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NeblQ0II04 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NeblQ0II04 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NeblQ0II04 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NeblQ0II04 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NeblQ0II04 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NeblQ0II04 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NeblQ0II04 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NeblQ0II04 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NeblQ0II04 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NeblQ0II04 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NeblQ0II04 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NeblQ0II04 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NeblQ0II04 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NeblQ0II04 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NeblQ0II04 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NeblQ0II04 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NeblQ0II04 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NeblQ0II04 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NeblQ0II04 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NeblQ0II04 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NeblQ0II04 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NeblQ0II04 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NeblQ0II04 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NeblQ0II04 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NeblQ0II04 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NeblQ0II04 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NeblQ0II04 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NeblQ0II04 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NeblQ0II04 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NeblQ0II04 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NeblQ0II04 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NeblQ0II04 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NeblQ0II04 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NeblQ0II04 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NeblQ0II04 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NeblQ0II04 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NeblQ0II04 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NeblQ0II04 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NeblQ0II04 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NeblQ0II04 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NeblQ0II04 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NeblQ0II04 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NeblQ0II04 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NeblQ0II04 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NeblQ0II04 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NeblQ0II04 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NeblQ0II04 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NeblQ0II04 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NeblQ0II04 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NeblQ0II04 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NeblQ0II04 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NeblQ0II04 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NeblQ0II04 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NeblQ0II04 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NeblQ0II04 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NeblQ0II04 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NeblQ0II04 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NeblQ0II04 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NeblQ0II04 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NeblQ0II04 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NeblQ0II04 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NeblQ0II04 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NeblQ0II04 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NeblQ0II04 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NeblQ0II04 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NeblQ0II04 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NeblQ0II04 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NeblQ0II04 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NeblQ0II04 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NeblQ0II04 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NeblQ0II04 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NeblQ0II04 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NeblQ0II04 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NeblQ0II04 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NeblQ0II04 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NeblQ0II04 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NeblQ0II04 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NeblQ0II04 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NeblQ0II04 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NeblQ0II04 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NeblQ0II04 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NeblQ0II04 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NeblQ0II04 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NeblQ0II04 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NeblQ0II04 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms