Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp2Q08652 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp2Q08652 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp2Q08652 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp2Q08652 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp2Q08652 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp2Q08652 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp2Q08652 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp2Q08652 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp2Q08652 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp2Q08652 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp2Q08652 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbp2Q08652 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbp2Q08652 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbp2Q08652 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp2Q08652 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp2Q08652 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp2Q08652 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp2Q08652 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbp2Q08652 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbp2Q08652 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbp2Q08652 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp2Q08652 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbp2Q08652 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbp2Q08652 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbp2Q08652 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp2Q08652 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp2Q08652 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp2Q08652 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp2Q08652 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbp2Q08652 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp2Q08652 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp2Q08652 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp2Q08652 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp2Q08652 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbp2Q08652 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbp2Q08652 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbp2Q08652 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbp2Q08652 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbp2Q08652 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbp2Q08652 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbp2Q08652 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbp2Q08652 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbp2Q08652 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbp2Q08652 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbp2Q08652 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbp2Q08652 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbp2Q08652 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbp2Q08652 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbp2Q08652 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbp2Q08652 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbp2Q08652 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbp2Q08652 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbp2Q08652 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbp2Q08652 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbp2Q08652 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbp2Q08652 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbp2Q08652 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbp2Q08652 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbp2Q08652 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbp2Q08652 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbp2Q08652 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbp2Q08652 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbp2Q08652 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp2Q08652 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp2Q08652 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp2Q08652 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbp2Q08652 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbp2Q08652 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbp2Q08652 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp2Q08652 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp2Q08652 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp2Q08652 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp2Q08652 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp2Q08652 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp2Q08652 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbp2Q08652 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbp2Q08652 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbp2Q08652 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp2Q08652 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp2Q08652 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp2Q08652 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp2Q08652 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp2Q08652 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp2Q08652 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp2Q08652 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp2Q08652 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp2Q08652 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp2Q08652 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rbp2Q08652 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbp2Q08652 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp2Q08652 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp2Q08652 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp2Q08652 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp2Q08652 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp2Q08652 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp2Q08652 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp2Q08652 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp2Q08652 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp2Q08652 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms